Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND4Q6ZU67 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BEND4Q6ZU67 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND4Q6ZU67 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND4Q6ZU67 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND4Q6ZU67 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND4Q6ZU67 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND4Q6ZU67 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND4Q6ZU67 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BEND4Q6ZU67 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND4Q6ZU67 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND4Q6ZU67 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND4Q6ZU67 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND4Q6ZU67 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BEND4Q6ZU67 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEND4Q6ZU67 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEND4Q6ZU67 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BEND4Q6ZU67 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BEND4Q6ZU67 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BEND4Q6ZU67 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BEND4Q6ZU67 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms