Protein–RNA interactions for Protein: Q6UUV7

CRTC3, CREB-regulated transcription coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTC3Q6UUV7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CRTC3Q6UUV7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRTC3Q6UUV7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRTC3Q6UUV7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRTC3Q6UUV7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRTC3Q6UUV7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRTC3Q6UUV7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRTC3Q6UUV7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRTC3Q6UUV7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRTC3Q6UUV7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRTC3Q6UUV7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CRTC3Q6UUV7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRTC3Q6UUV7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRTC3Q6UUV7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CRTC3Q6UUV7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CRTC3Q6UUV7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRTC3Q6UUV7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRTC3Q6UUV7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRTC3Q6UUV7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRTC3Q6UUV7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRTC3Q6UUV7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRTC3Q6UUV7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRTC3Q6UUV7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRTC3Q6UUV7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRTC3Q6UUV7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRTC3Q6UUV7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRTC3Q6UUV7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRTC3Q6UUV7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRTC3Q6UUV7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRTC3Q6UUV7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRTC3Q6UUV7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRTC3Q6UUV7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRTC3Q6UUV7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRTC3Q6UUV7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRTC3Q6UUV7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRTC3Q6UUV7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRTC3Q6UUV7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRTC3Q6UUV7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRTC3Q6UUV7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CRTC3Q6UUV7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CRTC3Q6UUV7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRTC3Q6UUV7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRTC3Q6UUV7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRTC3Q6UUV7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRTC3Q6UUV7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CRTC3Q6UUV7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRTC3Q6UUV7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRTC3Q6UUV7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRTC3Q6UUV7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRTC3Q6UUV7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRTC3Q6UUV7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRTC3Q6UUV7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRTC3Q6UUV7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRTC3Q6UUV7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTC3Q6UUV7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTC3Q6UUV7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTC3Q6UUV7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTC3Q6UUV7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTC3Q6UUV7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTC3Q6UUV7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CRTC3Q6UUV7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CRTC3Q6UUV7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRTC3Q6UUV7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.4 ms