Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPRIN2Q6IMN6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPRIN2Q6IMN6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPRIN2Q6IMN6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPRIN2Q6IMN6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPRIN2Q6IMN6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPRIN2Q6IMN6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CAPRIN2Q6IMN6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPRIN2Q6IMN6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPRIN2Q6IMN6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CAPRIN2Q6IMN6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPRIN2Q6IMN6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPRIN2Q6IMN6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPRIN2Q6IMN6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CAPRIN2Q6IMN6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPRIN2Q6IMN6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPRIN2Q6IMN6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPRIN2Q6IMN6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPRIN2Q6IMN6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CAPRIN2Q6IMN6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPRIN2Q6IMN6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CAPRIN2Q6IMN6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPRIN2Q6IMN6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CAPRIN2Q6IMN6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPRIN2Q6IMN6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPRIN2Q6IMN6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPRIN2Q6IMN6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPRIN2Q6IMN6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CAPRIN2Q6IMN6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPRIN2Q6IMN6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPRIN2Q6IMN6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPRIN2Q6IMN6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPRIN2Q6IMN6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPRIN2Q6IMN6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CAPRIN2Q6IMN6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPRIN2Q6IMN6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPRIN2Q6IMN6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CAPRIN2Q6IMN6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPRIN2Q6IMN6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPRIN2Q6IMN6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPRIN2Q6IMN6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAPRIN2Q6IMN6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPRIN2Q6IMN6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPRIN2Q6IMN6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAPRIN2Q6IMN6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CAPRIN2Q6IMN6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CAPRIN2Q6IMN6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPRIN2Q6IMN6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPRIN2Q6IMN6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CAPRIN2Q6IMN6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPRIN2Q6IMN6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPRIN2Q6IMN6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPRIN2Q6IMN6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPRIN2Q6IMN6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPRIN2Q6IMN6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPRIN2Q6IMN6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CAPRIN2Q6IMN6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPRIN2Q6IMN6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPRIN2Q6IMN6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPRIN2Q6IMN6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPRIN2Q6IMN6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPRIN2Q6IMN6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CAPRIN2Q6IMN6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPRIN2Q6IMN6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPRIN2Q6IMN6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CAPRIN2Q6IMN6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPRIN2Q6IMN6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPRIN2Q6IMN6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPRIN2Q6IMN6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CAPRIN2Q6IMN6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms