Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TXNDC8Q6A555 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TXNDC8Q6A555 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TXNDC8Q6A555 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TXNDC8Q6A555 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNDC8Q6A555 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms