Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TXNDC8Q6A555 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TXNDC8Q6A555 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TXNDC8Q6A555 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TXNDC8Q6A555 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TXNDC8Q6A555 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TXNDC8Q6A555 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
TXNDC8Q6A555 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TXNDC8Q6A555 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TXNDC8Q6A555 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TXNDC8Q6A555 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TXNDC8Q6A555 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TXNDC8Q6A555 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
TXNDC8Q6A555 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TXNDC8Q6A555 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TXNDC8Q6A555 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TXNDC8Q6A555 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TXNDC8Q6A555 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TXNDC8Q6A555 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TXNDC8Q6A555 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TXNDC8Q6A555 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
TXNDC8Q6A555 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TXNDC8Q6A555 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TXNDC8Q6A555 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TXNDC8Q6A555 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TXNDC8Q6A555 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TXNDC8Q6A555 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TXNDC8Q6A555 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TXNDC8Q6A555 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TXNDC8Q6A555 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TXNDC8Q6A555 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TXNDC8Q6A555 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TXNDC8Q6A555 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
TXNDC8Q6A555 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
TXNDC8Q6A555 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TXNDC8Q6A555 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TXNDC8Q6A555 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
TXNDC8Q6A555 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
TXNDC8Q6A555 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
TXNDC8Q6A555 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
TXNDC8Q6A555 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TXNDC8Q6A555 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
TXNDC8Q6A555 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
TXNDC8Q6A555 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TXNDC8Q6A555 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
TXNDC8Q6A555 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TXNDC8Q6A555 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TXNDC8Q6A555 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TXNDC8Q6A555 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TXNDC8Q6A555 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TXNDC8Q6A555 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TXNDC8Q6A555 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TXNDC8Q6A555 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TXNDC8Q6A555 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TXNDC8Q6A555 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TXNDC8Q6A555 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TXNDC8Q6A555 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TXNDC8Q6A555 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TXNDC8Q6A555 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TXNDC8Q6A555 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TXNDC8Q6A555 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TXNDC8Q6A555 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TXNDC8Q6A555 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TXNDC8Q6A555 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
TXNDC8Q6A555 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TXNDC8Q6A555 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
TXNDC8Q6A555 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
TXNDC8Q6A555 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
TXNDC8Q6A555 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TXNDC8Q6A555 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TXNDC8Q6A555 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TXNDC8Q6A555 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
TXNDC8Q6A555 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TXNDC8Q6A555 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TXNDC8Q6A555 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TXNDC8Q6A555 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
TXNDC8Q6A555 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TXNDC8Q6A555 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TXNDC8Q6A555 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TXNDC8Q6A555 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TXNDC8Q6A555 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TXNDC8Q6A555 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
TXNDC8Q6A555 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
TXNDC8Q6A555 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
TXNDC8Q6A555 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TXNDC8Q6A555 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TXNDC8Q6A555 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TXNDC8Q6A555 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
TXNDC8Q6A555 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TXNDC8Q6A555 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TXNDC8Q6A555 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TXNDC8Q6A555 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TXNDC8Q6A555 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TXNDC8Q6A555 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TXNDC8Q6A555 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
TXNDC8Q6A555 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
TXNDC8Q6A555 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
TXNDC8Q6A555 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
TXNDC8Q6A555 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
TXNDC8Q6A555 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms