Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PAX2Q02962 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PAX2Q02962 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PAX2Q02962 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PAX2Q02962 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms