Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PAX2Q02962 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAX2Q02962 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PAX2Q02962 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PAX2Q02962 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PAX2Q02962 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PAX2Q02962 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PAX2Q02962 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAX2Q02962 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PAX2Q02962 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAX2Q02962 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PAX2Q02962 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAX2Q02962 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PAX2Q02962 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PAX2Q02962 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PAX2Q02962 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PAX2Q02962 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PAX2Q02962 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PAX2Q02962 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PAX2Q02962 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PAX2Q02962 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PAX2Q02962 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PAX2Q02962 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAX2Q02962 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PAX2Q02962 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAX2Q02962 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAX2Q02962 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAX2Q02962 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAX2Q02962 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAX2Q02962 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAX2Q02962 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAX2Q02962 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAX2Q02962 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAX2Q02962 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAX2Q02962 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAX2Q02962 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAX2Q02962 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAX2Q02962 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAX2Q02962 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAX2Q02962 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PAX2Q02962 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PAX2Q02962 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAX2Q02962 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PAX2Q02962 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAX2Q02962 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PAX2Q02962 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PAX2Q02962 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PAX2Q02962 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PAX2Q02962 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PAX2Q02962 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PAX2Q02962 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAX2Q02962 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PAX2Q02962 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PAX2Q02962 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAX2Q02962 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAX2Q02962 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAX2Q02962 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAX2Q02962 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAX2Q02962 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PAX2Q02962 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PAX2Q02962 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PAX2Q02962 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PAX2Q02962 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PAX2Q02962 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PAX2Q02962 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PAX2Q02962 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAX2Q02962 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAX2Q02962 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAX2Q02962 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAX2Q02962 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAX2Q02962 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAX2Q02962 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAX2Q02962 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAX2Q02962 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAX2Q02962 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAX2Q02962 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAX2Q02962 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAX2Q02962 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAX2Q02962 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAX2Q02962 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PAX2Q02962 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAX2Q02962 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAX2Q02962 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAX2Q02962 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAX2Q02962 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAX2Q02962 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAX2Q02962 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAX2Q02962 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAX2Q02962 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAX2Q02962 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAX2Q02962 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAX2Q02962 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAX2Q02962 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAX2Q02962 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAX2Q02962 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAX2Q02962 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAX2Q02962 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PAX2Q02962 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PAX2Q02962 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAX2Q02962 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.2 ms