Protein–RNA interactions for Protein: Q01650

SLC7A5, Large neutral amino acids transporter small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A5Q01650 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC7A5Q01650 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC7A5Q01650 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC7A5Q01650 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC7A5Q01650 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC7A5Q01650 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC7A5Q01650 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC7A5Q01650 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC7A5Q01650 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC7A5Q01650 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC7A5Q01650 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC7A5Q01650 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC7A5Q01650 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC7A5Q01650 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC7A5Q01650 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC7A5Q01650 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC7A5Q01650 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC7A5Q01650 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC7A5Q01650 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC7A5Q01650 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC7A5Q01650 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC7A5Q01650 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC7A5Q01650 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC7A5Q01650 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC7A5Q01650 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC7A5Q01650 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC7A5Q01650 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC7A5Q01650 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC7A5Q01650 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC7A5Q01650 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC7A5Q01650 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC7A5Q01650 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC7A5Q01650 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC7A5Q01650 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC7A5Q01650 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC7A5Q01650 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC7A5Q01650 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC7A5Q01650 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC7A5Q01650 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC7A5Q01650 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC7A5Q01650 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC7A5Q01650 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC7A5Q01650 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC7A5Q01650 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC7A5Q01650 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC7A5Q01650 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC7A5Q01650 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SLC7A5Q01650 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC7A5Q01650 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC7A5Q01650 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC7A5Q01650 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC7A5Q01650 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC7A5Q01650 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC7A5Q01650 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC7A5Q01650 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC7A5Q01650 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC7A5Q01650 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC7A5Q01650 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC7A5Q01650 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC7A5Q01650 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC7A5Q01650 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC7A5Q01650 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC7A5Q01650 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC7A5Q01650 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC7A5Q01650 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC7A5Q01650 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC7A5Q01650 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC7A5Q01650 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC7A5Q01650 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC7A5Q01650 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC7A5Q01650 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC7A5Q01650 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC7A5Q01650 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC7A5Q01650 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC7A5Q01650 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC7A5Q01650 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC7A5Q01650 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC7A5Q01650 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC7A5Q01650 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC7A5Q01650 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC7A5Q01650 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC7A5Q01650 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC7A5Q01650 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC7A5Q01650 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC7A5Q01650 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC7A5Q01650 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC7A5Q01650 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC7A5Q01650 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC7A5Q01650 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC7A5Q01650 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC7A5Q01650 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC7A5Q01650 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC7A5Q01650 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC7A5Q01650 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC7A5Q01650 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLC7A5Q01650 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC7A5Q01650 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC7A5Q01650 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC7A5Q01650 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC7A5Q01650 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms