Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKP1P63208 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKP1P63208 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKP1P63208 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKP1P63208 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKP1P63208 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SKP1P63208 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKP1P63208 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKP1P63208 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SKP1P63208 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKP1P63208 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SKP1P63208 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKP1P63208 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKP1P63208 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKP1P63208 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SKP1P63208 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKP1P63208 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SKP1P63208 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKP1P63208 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SKP1P63208 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKP1P63208 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKP1P63208 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SKP1P63208 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SKP1P63208 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SKP1P63208 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKP1P63208 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKP1P63208 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKP1P63208 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKP1P63208 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SKP1P63208 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SKP1P63208 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKP1P63208 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKP1P63208 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKP1P63208 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKP1P63208 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKP1P63208 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKP1P63208 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKP1P63208 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SKP1P63208 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKP1P63208 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKP1P63208 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKP1P63208 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKP1P63208 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SKP1P63208 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKP1P63208 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SKP1P63208 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKP1P63208 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SKP1P63208 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKP1P63208 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKP1P63208 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SKP1P63208 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SKP1P63208 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKP1P63208 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKP1P63208 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKP1P63208 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKP1P63208 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKP1P63208 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKP1P63208 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKP1P63208 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SKP1P63208 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SKP1P63208 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKP1P63208 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SKP1P63208 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SKP1P63208 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKP1P63208 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SKP1P63208 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKP1P63208 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKP1P63208 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKP1P63208 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKP1P63208 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SKP1P63208 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKP1P63208 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKP1P63208 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKP1P63208 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKP1P63208 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SKP1P63208 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKP1P63208 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKP1P63208 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKP1P63208 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKP1P63208 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SKP1P63208 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKP1P63208 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKP1P63208 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKP1P63208 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SKP1P63208 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SKP1P63208 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SKP1P63208 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKP1P63208 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SKP1P63208 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKP1P63208 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKP1P63208 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKP1P63208 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKP1P63208 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKP1P63208 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SKP1P63208 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKP1P63208 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SKP1P63208 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SKP1P63208 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKP1P63208 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SKP1P63208 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms