Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPL9P32969 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPL9P32969 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPL9P32969 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPL9P32969 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPL9P32969 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPL9P32969 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPL9P32969 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPL9P32969 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPL9P32969 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPL9P32969 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPL9P32969 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPL9P32969 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RPL9P32969 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPL9P32969 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPL9P32969 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPL9P32969 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPL9P32969 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPL9P32969 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPL9P32969 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RPL9P32969 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPL9P32969 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPL9P32969 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RPL9P32969 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPL9P32969 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPL9P32969 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPL9P32969 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPL9P32969 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPL9P32969 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPL9P32969 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPL9P32969 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPL9P32969 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPL9P32969 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPL9P32969 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPL9P32969 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPL9P32969 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPL9P32969 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPL9P32969 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPL9P32969 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPL9P32969 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPL9P32969 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPL9P32969 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPL9P32969 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPL9P32969 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPL9P32969 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPL9P32969 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPL9P32969 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPL9P32969 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RPL9P32969 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPL9P32969 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPL9P32969 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPL9P32969 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
RPL9P32969 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPL9P32969 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPL9P32969 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RPL9P32969 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPL9P32969 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPL9P32969 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPL9P32969 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPL9P32969 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPL9P32969 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPL9P32969 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RPL9P32969 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPL9P32969 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPL9P32969 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RPL9P32969 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPL9P32969 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RPL9P32969 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPL9P32969 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPL9P32969 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RPL9P32969 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPL9P32969 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RPL9P32969 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RPL9P32969 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPL9P32969 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPL9P32969 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RPL9P32969 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPL9P32969 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPL9P32969 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPL9P32969 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RPL9P32969 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPL9P32969 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPL9P32969 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPL9P32969 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RPL9P32969 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPL9P32969 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RPL9P32969 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPL9P32969 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RPL9P32969 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPL9P32969 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPL9P32969 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RPL9P32969 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPL9P32969 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPL9P32969 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RPL9P32969 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPL9P32969 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RPL9P32969 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPL9P32969 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
RPL9P32969 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RPL9P32969 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms