Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGA4P13612 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ITGA4P13612 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ITGA4P13612 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGA4P13612 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGA4P13612 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGA4P13612 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGA4P13612 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGA4P13612 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGA4P13612 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGA4P13612 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGA4P13612 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGA4P13612 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGA4P13612 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGA4P13612 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGA4P13612 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGA4P13612 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGA4P13612 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGA4P13612 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGA4P13612 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA4P13612 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA4P13612 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA4P13612 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGA4P13612 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ITGA4P13612 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGA4P13612 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGA4P13612 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGA4P13612 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGA4P13612 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGA4P13612 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGA4P13612 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGA4P13612 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGA4P13612 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGA4P13612 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGA4P13612 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGA4P13612 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGA4P13612 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITGA4P13612 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGA4P13612 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGA4P13612 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGA4P13612 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGA4P13612 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGA4P13612 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGA4P13612 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGA4P13612 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGA4P13612 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGA4P13612 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGA4P13612 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGA4P13612 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGA4P13612 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ITGA4P13612 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ITGA4P13612 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ITGA4P13612 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms