Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CYBBP04839 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYBBP04839 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYBBP04839 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CYBBP04839 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CYBBP04839 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYBBP04839 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYBBP04839 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYBBP04839 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYBBP04839 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CYBBP04839 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYBBP04839 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CYBBP04839 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYBBP04839 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYBBP04839 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CYBBP04839 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYBBP04839 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CYBBP04839 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYBBP04839 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYBBP04839 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYBBP04839 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYBBP04839 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYBBP04839 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYBBP04839 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CYBBP04839 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYBBP04839 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYBBP04839 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYBBP04839 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CYBBP04839 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYBBP04839 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYBBP04839 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CYBBP04839 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CYBBP04839 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CYBBP04839 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYBBP04839 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYBBP04839 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CYBBP04839 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYBBP04839 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYBBP04839 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYBBP04839 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYBBP04839 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYBBP04839 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYBBP04839 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CYBBP04839 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYBBP04839 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CYBBP04839 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYBBP04839 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CYBBP04839 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYBBP04839 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CYBBP04839 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYBBP04839 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CYBBP04839 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYBBP04839 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CYBBP04839 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYBBP04839 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYBBP04839 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CYBBP04839 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYBBP04839 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYBBP04839 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CYBBP04839 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYBBP04839 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYBBP04839 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYBBP04839 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYBBP04839 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYBBP04839 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYBBP04839 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYBBP04839 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CYBBP04839 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYBBP04839 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYBBP04839 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYBBP04839 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CYBBP04839 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYBBP04839 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYBBP04839 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CYBBP04839 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYBBP04839 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CYBBP04839 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYBBP04839 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYBBP04839 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYBBP04839 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYBBP04839 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYBBP04839 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYBBP04839 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYBBP04839 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CYBBP04839 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYBBP04839 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYBBP04839 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYBBP04839 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CYBBP04839 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CYBBP04839 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYBBP04839 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CYBBP04839 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CYBBP04839 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYBBP04839 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYBBP04839 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CYBBP04839 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYBBP04839 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYBBP04839 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYBBP04839 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CYBBP04839 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms