Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLDN3O15551 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLDN3O15551 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLDN3O15551 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLDN3O15551 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLDN3O15551 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLDN3O15551 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLDN3O15551 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLDN3O15551 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLDN3O15551 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLDN3O15551 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLDN3O15551 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLDN3O15551 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLDN3O15551 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLDN3O15551 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLDN3O15551 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLDN3O15551 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLDN3O15551 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLDN3O15551 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLDN3O15551 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLDN3O15551 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLDN3O15551 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLDN3O15551 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLDN3O15551 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLDN3O15551 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLDN3O15551 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLDN3O15551 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLDN3O15551 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLDN3O15551 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLDN3O15551 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLDN3O15551 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLDN3O15551 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLDN3O15551 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLDN3O15551 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLDN3O15551 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLDN3O15551 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CLDN3O15551 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLDN3O15551 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLDN3O15551 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLDN3O15551 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLDN3O15551 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLDN3O15551 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLDN3O15551 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLDN3O15551 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLDN3O15551 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLDN3O15551 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLDN3O15551 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLDN3O15551 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CLDN3O15551 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLDN3O15551 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLDN3O15551 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLDN3O15551 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLDN3O15551 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLDN3O15551 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLDN3O15551 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLDN3O15551 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLDN3O15551 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLDN3O15551 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLDN3O15551 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLDN3O15551 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLDN3O15551 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLDN3O15551 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CLDN3O15551 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLDN3O15551 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLDN3O15551 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLDN3O15551 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLDN3O15551 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLDN3O15551 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLDN3O15551 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLDN3O15551 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLDN3O15551 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLDN3O15551 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLDN3O15551 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms