Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQ67

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQ67 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A1W2PQ67 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2PQ67 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2PQ67 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2PQ67 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1W2PQ67 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1W2PQ67 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1W2PQ67 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1W2PQ67 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1W2PQ67 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1W2PQ67 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A1W2PQ67 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A1W2PQ67 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A1W2PQ67 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A1W2PQ67 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A1W2PQ67 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A1W2PQ67 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A1W2PQ67 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A1W2PQ67 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A1W2PQ67 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1W2PQ67 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1W2PQ67 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1W2PQ67 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1W2PQ67 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1W2PQ67 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1W2PQ67 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1W2PQ67 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A1W2PQ67 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A1W2PQ67 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A1W2PQ67 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A1W2PQ67 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A1W2PQ67 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
A0A1W2PQ67 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ67 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ67 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ67 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ67 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ67 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ67 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ67 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ67 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ67 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ67 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ67 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ67 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ67 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ67 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ67 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A1W2PQ67 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ67 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ67 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ67 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ67 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ67 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ67 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ67 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ67 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ67 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ67 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ67 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ67 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ67 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ67 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ67 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ67 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ67 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ67 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A1W2PQ67 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms