Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HECTD4Q9Y4D8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HECTD4Q9Y4D8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HECTD4Q9Y4D8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HECTD4Q9Y4D8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HECTD4Q9Y4D8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HECTD4Q9Y4D8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HECTD4Q9Y4D8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HECTD4Q9Y4D8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HECTD4Q9Y4D8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HECTD4Q9Y4D8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HECTD4Q9Y4D8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HECTD4Q9Y4D8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HECTD4Q9Y4D8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HECTD4Q9Y4D8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HECTD4Q9Y4D8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HECTD4Q9Y4D8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HECTD4Q9Y4D8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HECTD4Q9Y4D8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HECTD4Q9Y4D8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HECTD4Q9Y4D8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HECTD4Q9Y4D8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HECTD4Q9Y4D8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HECTD4Q9Y4D8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HECTD4Q9Y4D8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HECTD4Q9Y4D8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HECTD4Q9Y4D8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HECTD4Q9Y4D8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HECTD4Q9Y4D8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HECTD4Q9Y4D8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HECTD4Q9Y4D8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HECTD4Q9Y4D8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HECTD4Q9Y4D8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HECTD4Q9Y4D8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HECTD4Q9Y4D8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HECTD4Q9Y4D8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HECTD4Q9Y4D8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HECTD4Q9Y4D8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HECTD4Q9Y4D8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HECTD4Q9Y4D8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
HECTD4Q9Y4D8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms