Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HECTD4Q9Y4D8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HECTD4Q9Y4D8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HECTD4Q9Y4D8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HECTD4Q9Y4D8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HECTD4Q9Y4D8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HECTD4Q9Y4D8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HECTD4Q9Y4D8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HECTD4Q9Y4D8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HECTD4Q9Y4D8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HECTD4Q9Y4D8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HECTD4Q9Y4D8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HECTD4Q9Y4D8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HECTD4Q9Y4D8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HECTD4Q9Y4D8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HECTD4Q9Y4D8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HECTD4Q9Y4D8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HECTD4Q9Y4D8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HECTD4Q9Y4D8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HECTD4Q9Y4D8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HECTD4Q9Y4D8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
HECTD4Q9Y4D8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HECTD4Q9Y4D8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HECTD4Q9Y4D8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HECTD4Q9Y4D8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HECTD4Q9Y4D8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HECTD4Q9Y4D8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HECTD4Q9Y4D8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HECTD4Q9Y4D8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HECTD4Q9Y4D8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HECTD4Q9Y4D8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HECTD4Q9Y4D8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
HECTD4Q9Y4D8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HECTD4Q9Y4D8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HECTD4Q9Y4D8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HECTD4Q9Y4D8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HECTD4Q9Y4D8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HECTD4Q9Y4D8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
HECTD4Q9Y4D8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HECTD4Q9Y4D8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
HECTD4Q9Y4D8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HECTD4Q9Y4D8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HECTD4Q9Y4D8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HECTD4Q9Y4D8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HECTD4Q9Y4D8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HECTD4Q9Y4D8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HECTD4Q9Y4D8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HECTD4Q9Y4D8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HECTD4Q9Y4D8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HECTD4Q9Y4D8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HECTD4Q9Y4D8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HECTD4Q9Y4D8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HECTD4Q9Y4D8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HECTD4Q9Y4D8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HECTD4Q9Y4D8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HECTD4Q9Y4D8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HECTD4Q9Y4D8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HECTD4Q9Y4D8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HECTD4Q9Y4D8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HECTD4Q9Y4D8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HECTD4Q9Y4D8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HECTD4Q9Y4D8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HECTD4Q9Y4D8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HECTD4Q9Y4D8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HECTD4Q9Y4D8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HECTD4Q9Y4D8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HECTD4Q9Y4D8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HECTD4Q9Y4D8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HECTD4Q9Y4D8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HECTD4Q9Y4D8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HECTD4Q9Y4D8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HECTD4Q9Y4D8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HECTD4Q9Y4D8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HECTD4Q9Y4D8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HECTD4Q9Y4D8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HECTD4Q9Y4D8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HECTD4Q9Y4D8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HECTD4Q9Y4D8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HECTD4Q9Y4D8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HECTD4Q9Y4D8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HECTD4Q9Y4D8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HECTD4Q9Y4D8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HECTD4Q9Y4D8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HECTD4Q9Y4D8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HECTD4Q9Y4D8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HECTD4Q9Y4D8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HECTD4Q9Y4D8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HECTD4Q9Y4D8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HECTD4Q9Y4D8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HECTD4Q9Y4D8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HECTD4Q9Y4D8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HECTD4Q9Y4D8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HECTD4Q9Y4D8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HECTD4Q9Y4D8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HECTD4Q9Y4D8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HECTD4Q9Y4D8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HECTD4Q9Y4D8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
HECTD4Q9Y4D8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HECTD4Q9Y4D8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
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