RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538015.1

TIE1-210, Transcript of tyrosine kinase with immunoglobulin like and EGF like domains 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TIE1, Length 1,140 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIE1-210ENST00000538015 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.78■■■■■ 7
TIE1-210ENST00000538015 ABCC9O60706 1549 aa52.81■■■■■ 6.04
TIE1-210ENST00000538015 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.71■■■■■ 6.03
TIE1-210ENST00000538015 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.2■■■■■ 5.63
TIE1-210ENST00000538015 NACADO15069 1562 aa49.87■■■■■ 5.57
TIE1-210ENST00000538015 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.67■■■■■ 5.54
TIE1-210ENST00000538015 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.61■■■■■ 5.53
TIE1-210ENST00000538015 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.19■■■■■ 5.46
TIE1-210ENST00000538015 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.18■■■■■ 5.46
TIE1-210ENST00000538015 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.1■■■■■ 5.45
TIE1-210ENST00000538015 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.82■■■■■ 5.41
TIE1-210ENST00000538015 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.71■■■■■ 5.39
TIE1-210ENST00000538015 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.54■■■■■ 5.36
TIE1-210ENST00000538015 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.08■■■■■ 5.29
TIE1-210ENST00000538015 SCRIBQ14160 1630 aa48.05■■■■■ 5.28
TIE1-210ENST00000538015 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.69■■■■■ 5.22
TIE1-210ENST00000538015 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.58■■■■■ 5.21
TIE1-210ENST00000538015 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.56■■■■■ 5.2
TIE1-210ENST00000538015 NCAPD3P42695 1498 aa46.07■■■■■ 4.97
TIE1-210ENST00000538015 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.93■■■■■ 4.94
TIE1-210ENST00000538015 SMARCA4P51532 1647 aa45.85■■■■■ 4.93
TIE1-210ENST00000538015 SMARCA2P51531 1590 aa45.75■■■■■ 4.92
TIE1-210ENST00000538015 HMGXB3Q12766 1538 aa45.69■■■■■ 4.9
TIE1-210ENST00000538015 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.59■■■■■ 4.89
TIE1-210ENST00000538015 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.58■■■■■ 4.89
TIE1-210ENST00000538015 ERCC6Q03468 1493 aa45.55■■■■■ 4.88
TIE1-210ENST00000538015 CUX2O14529 1486 aa45.49■■■■■ 4.87
TIE1-210ENST00000538015 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.44■■■■■ 4.87
TIE1-210ENST00000538015 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.41■■■■■ 4.86
TIE1-210ENST00000538015 NESP48681 1621 aa45.38■■■■■ 4.86
TIE1-210ENST00000538015 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.32■■■■■ 4.85
TIE1-210ENST00000538015 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.99■■■■■ 4.79
TIE1-210ENST00000538015 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.9■■■■■ 4.78
TIE1-210ENST00000538015 WIZO95785 1651 aa44.75■■■■■ 4.75
TIE1-210ENST00000538015 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.75■■■■■ 4.75
TIE1-210ENST00000538015 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.74■■■■■ 4.75
TIE1-210ENST00000538015 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.67■■■■■ 4.74
TIE1-210ENST00000538015 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.37■■■■■ 4.69
TIE1-210ENST00000538015 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.36■■■■■ 4.69
TIE1-210ENST00000538015 WDR62O43379 1518 aa44.27■■■■■ 4.68
TIE1-210ENST00000538015 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.17■■■■■ 4.66
TIE1-210ENST00000538015 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.16■■■■■ 4.66
TIE1-210ENST00000538015 CFTRP13569 1480 aa44.15■■■■■ 4.66
TIE1-210ENST00000538015 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.15■■■■■ 4.66
TIE1-210ENST00000538015 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.82■■■■■ 4.61
TIE1-210ENST00000538015 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.7■■■■■ 4.59
TIE1-210ENST00000538015 PRDM2Q13029 1718 aa43.64■■■■■ 4.58
TIE1-210ENST00000538015 TRIM41Q8WV44 630 aa43.52■■■■■ 4.56
TIE1-210ENST00000538015 OSCARQ8IYS5 282 aa43.44■■■■■ 4.54
TIE1-210ENST00000538015 TOPBP1Q92547 1522 aa43.32■■■■■ 4.52
TIE1-210ENST00000538015 IFT140Q96RY7 1462 aa43.3■■■■■ 4.52
TIE1-210ENST00000538015 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.29■■■■■ 4.52
TIE1-210ENST00000538015 ABCC8Q09428 1581 aa43.17■■■■■ 4.5
TIE1-210ENST00000538015 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.12■■■■■ 4.49
TIE1-210ENST00000538015 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.99■■■■■ 4.47
TIE1-210ENST00000538015 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.94■■■■■ 4.46
TIE1-210ENST00000538015 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.88■■■■■ 4.46
TIE1-210ENST00000538015 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.87■■■■■ 4.45
TIE1-210ENST00000538015 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.87■■■■■ 4.45
TIE1-210ENST00000538015 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.87■■■■■ 4.45
TIE1-210ENST00000538015 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.87■■■■■ 4.45
TIE1-210ENST00000538015 ARHGEF11O15085 1522 aa42.74■■■■■ 4.43
TIE1-210ENST00000538015 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.74■■■■■ 4.43
TIE1-210ENST00000538015 CHD1O14646 1710 aa42.68■■■■■ 4.42
TIE1-210ENST00000538015 SOGA1O94964 1423 aa42.67■■■■■ 4.42
TIE1-210ENST00000538015 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.62■■■■■ 4.41
TIE1-210ENST00000538015 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.59■■■■■ 4.41
TIE1-210ENST00000538015 CUX1P39880 1505 aa42.57■■■■■ 4.41
TIE1-210ENST00000538015 FBLN2P98095 1184 aa42.57■■■■■ 4.41
TIE1-210ENST00000538015 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.44■■■■■ 4.38
TIE1-210ENST00000538015 WDR97A6NE52 1622 aa42.44■■■■■ 4.38
TIE1-210ENST00000538015 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.42■■■■■ 4.38
TIE1-210ENST00000538015 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
TIE1-210ENST00000538015 ARAP1Q96P48 1450 aa42.34■■■■■ 4.37
TIE1-210ENST00000538015 GRIN2BQ13224 1484 aa42.29■■■■■ 4.36
TIE1-210ENST00000538015 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.29■■■■■ 4.36
TIE1-210ENST00000538015 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.25■■■■■ 4.35
TIE1-210ENST00000538015 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.22■■■■■ 4.35
TIE1-210ENST00000538015 SYNJ2O15056 1496 aa42.16■■■■■ 4.34
TIE1-210ENST00000538015 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.15■■■■■ 4.34
TIE1-210ENST00000538015 SYNJ1O43426 1573 aa42.14■■■■■ 4.34
TIE1-210ENST00000538015 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.11■■■■■ 4.33
TIE1-210ENST00000538015 PBRM1Q86U86 1689 aa42.09■■■■■ 4.33
TIE1-210ENST00000538015 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.04■■■■■ 4.32
TIE1-210ENST00000538015 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.94■■■■■ 4.3
TIE1-210ENST00000538015 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.91■■■■■ 4.3
TIE1-210ENST00000538015 TOP2BQ02880 1626 aa41.84■■■■■ 4.29
TIE1-210ENST00000538015 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.84■■■■■ 4.29
TIE1-210ENST00000538015 GRIN2AQ12879 1464 aa41.75■■■■■ 4.27
TIE1-210ENST00000538015 ADAMTS12P58397 1594 aa41.71■■■■■ 4.27
TIE1-210ENST00000538015 NUP160Q12769 1436 aa41.64■■■■■ 4.26
TIE1-210ENST00000538015 CEP170Q5SW79 1584 aa41.62■■■■■ 4.25
TIE1-210ENST00000538015 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.61■■■■■ 4.25
TIE1-210ENST00000538015 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.59■■■■■ 4.25
TIE1-210ENST00000538015 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.56■■■■■ 4.24
TIE1-210ENST00000538015 SHROOM2Q13796 1616 aa41.44■■■■■ 4.22
TIE1-210ENST00000538015 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
TIE1-210ENST00000538015 JPH4Q96JJ6 628 aa41.22■■■■■ 4.19
TIE1-210ENST00000538015 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.13■■■■■ 4.17
TIE1-210ENST00000538015 IGF1RP08069 1367 aa41.08■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms