RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328435.2

CTAG1B-201, Transcript of cancer/testis antigen 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTAG1B, Length 748 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAG1B-201ENST00000328435 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.75■■■■■ 7
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CTAG1B-201ENST00000328435 IFT140Q96RY7 1462 aa43.12■■■■■ 4.49
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CTAG1B-201ENST00000328435 SOGA1O94964 1423 aa42.54■■■■■ 4.4
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CTAG1B-201ENST00000328435 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.53■■■■■ 4.4
CTAG1B-201ENST00000328435 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.53■■■■■ 4.4
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CTAG1B-201ENST00000328435 WDR97A6NE52 1622 aa42.32■■■■■ 4.37
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CTAG1B-201ENST00000328435 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.95■■■■■ 4.31
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CTAG1B-201ENST00000328435 NUP160Q12769 1436 aa41.48■■■■■ 4.23
CTAG1B-201ENST00000328435 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.45■■■■■ 4.23
CTAG1B-201ENST00000328435 SHROOM2Q13796 1616 aa41.29■■■■■ 4.2
CTAG1B-201ENST00000328435 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.13■■■■■ 4.18
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CTAG1B-201ENST00000328435 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.16
CTAG1B-201ENST00000328435 CUL7Q14999 1698 aa41.01■■■■■ 4.15
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