Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN8AQ9UQD0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN8AQ9UQD0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCN8AQ9UQD0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SCN8AQ9UQD0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SCN8AQ9UQD0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN8AQ9UQD0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCN8AQ9UQD0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN8AQ9UQD0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN8AQ9UQD0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN8AQ9UQD0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCN8AQ9UQD0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN8AQ9UQD0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN8AQ9UQD0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCN8AQ9UQD0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN8AQ9UQD0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN8AQ9UQD0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN8AQ9UQD0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCN8AQ9UQD0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN8AQ9UQD0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN8AQ9UQD0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN8AQ9UQD0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SCN8AQ9UQD0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN8AQ9UQD0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN8AQ9UQD0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN8AQ9UQD0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCN8AQ9UQD0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCN8AQ9UQD0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCN8AQ9UQD0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCN8AQ9UQD0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN8AQ9UQD0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN8AQ9UQD0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN8AQ9UQD0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN8AQ9UQD0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCN8AQ9UQD0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN8AQ9UQD0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN8AQ9UQD0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN8AQ9UQD0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCN8AQ9UQD0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN8AQ9UQD0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN8AQ9UQD0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN8AQ9UQD0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCN8AQ9UQD0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN8AQ9UQD0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN8AQ9UQD0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN8AQ9UQD0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN8AQ9UQD0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCN8AQ9UQD0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCN8AQ9UQD0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN8AQ9UQD0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN8AQ9UQD0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN8AQ9UQD0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN8AQ9UQD0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN8AQ9UQD0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCN8AQ9UQD0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCN8AQ9UQD0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN8AQ9UQD0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN8AQ9UQD0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCN8AQ9UQD0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCN8AQ9UQD0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN8AQ9UQD0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN8AQ9UQD0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN8AQ9UQD0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN8AQ9UQD0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCN8AQ9UQD0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN8AQ9UQD0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN8AQ9UQD0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN8AQ9UQD0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCN8AQ9UQD0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCN8AQ9UQD0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN8AQ9UQD0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN8AQ9UQD0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms