Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVK-5Q9HDB9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVK-5Q9HDB9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVK-5Q9HDB9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ERVK-5Q9HDB9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERVK-5Q9HDB9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ERVK-5Q9HDB9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVK-5Q9HDB9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVK-5Q9HDB9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ERVK-5Q9HDB9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVK-5Q9HDB9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVK-5Q9HDB9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVK-5Q9HDB9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVK-5Q9HDB9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVK-5Q9HDB9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVK-5Q9HDB9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVK-5Q9HDB9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVK-5Q9HDB9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVK-5Q9HDB9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVK-5Q9HDB9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVK-5Q9HDB9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVK-5Q9HDB9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVK-5Q9HDB9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ERVK-5Q9HDB9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVK-5Q9HDB9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVK-5Q9HDB9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVK-5Q9HDB9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ERVK-5Q9HDB9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERVK-5Q9HDB9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ERVK-5Q9HDB9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVK-5Q9HDB9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ERVK-5Q9HDB9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVK-5Q9HDB9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVK-5Q9HDB9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ERVK-5Q9HDB9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ERVK-5Q9HDB9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ERVK-5Q9HDB9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ERVK-5Q9HDB9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVK-5Q9HDB9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVK-5Q9HDB9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVK-5Q9HDB9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ERVK-5Q9HDB9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVK-5Q9HDB9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVK-5Q9HDB9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ERVK-5Q9HDB9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVK-5Q9HDB9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVK-5Q9HDB9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ERVK-5Q9HDB9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVK-5Q9HDB9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVK-5Q9HDB9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVK-5Q9HDB9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ERVK-5Q9HDB9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVK-5Q9HDB9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ERVK-5Q9HDB9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ERVK-5Q9HDB9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ERVK-5Q9HDB9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVK-5Q9HDB9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVK-5Q9HDB9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ERVK-5Q9HDB9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVK-5Q9HDB9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVK-5Q9HDB9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVK-5Q9HDB9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ERVK-5Q9HDB9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVK-5Q9HDB9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVK-5Q9HDB9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ERVK-5Q9HDB9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVK-5Q9HDB9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ERVK-5Q9HDB9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ERVK-5Q9HDB9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ERVK-5Q9HDB9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVK-5Q9HDB9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVK-5Q9HDB9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVK-5Q9HDB9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ERVK-5Q9HDB9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVK-5Q9HDB9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVK-5Q9HDB9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVK-5Q9HDB9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ERVK-5Q9HDB9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVK-5Q9HDB9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ERVK-5Q9HDB9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVK-5Q9HDB9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVK-5Q9HDB9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVK-5Q9HDB9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVK-5Q9HDB9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVK-5Q9HDB9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVK-5Q9HDB9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ERVK-5Q9HDB9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVK-5Q9HDB9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVK-5Q9HDB9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ERVK-5Q9HDB9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
ERVK-5Q9HDB9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERVK-5Q9HDB9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERVK-5Q9HDB9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERVK-5Q9HDB9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ERVK-5Q9HDB9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVK-5Q9HDB9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVK-5Q9HDB9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ERVK-5Q9HDB9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms