Protein–RNA interactions for Protein: Q99700

ATXN2, Ataxin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN2Q99700 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATXN2Q99700 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATXN2Q99700 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATXN2Q99700 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ATXN2Q99700 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ATXN2Q99700 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATXN2Q99700 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATXN2Q99700 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATXN2Q99700 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATXN2Q99700 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ATXN2Q99700 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATXN2Q99700 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATXN2Q99700 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATXN2Q99700 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATXN2Q99700 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATXN2Q99700 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ATXN2Q99700 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATXN2Q99700 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATXN2Q99700 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATXN2Q99700 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATXN2Q99700 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATXN2Q99700 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ATXN2Q99700 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATXN2Q99700 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATXN2Q99700 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATXN2Q99700 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATXN2Q99700 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATXN2Q99700 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATXN2Q99700 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATXN2Q99700 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATXN2Q99700 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATXN2Q99700 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATXN2Q99700 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATXN2Q99700 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATXN2Q99700 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATXN2Q99700 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATXN2Q99700 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATXN2Q99700 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATXN2Q99700 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATXN2Q99700 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATXN2Q99700 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATXN2Q99700 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATXN2Q99700 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATXN2Q99700 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATXN2Q99700 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATXN2Q99700 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATXN2Q99700 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATXN2Q99700 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATXN2Q99700 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATXN2Q99700 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATXN2Q99700 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATXN2Q99700 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATXN2Q99700 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATXN2Q99700 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATXN2Q99700 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATXN2Q99700 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATXN2Q99700 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATXN2Q99700 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATXN2Q99700 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATXN2Q99700 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATXN2Q99700 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATXN2Q99700 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATXN2Q99700 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ATXN2Q99700 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATXN2Q99700 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATXN2Q99700 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATXN2Q99700 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATXN2Q99700 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms