Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNX27Q96L92 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNX27Q96L92 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNX27Q96L92 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNX27Q96L92 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SNX27Q96L92 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SNX27Q96L92 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SNX27Q96L92 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX27Q96L92 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNX27Q96L92 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNX27Q96L92 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNX27Q96L92 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNX27Q96L92 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SNX27Q96L92 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNX27Q96L92 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX27Q96L92 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNX27Q96L92 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX27Q96L92 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX27Q96L92 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX27Q96L92 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX27Q96L92 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX27Q96L92 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX27Q96L92 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNX27Q96L92 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX27Q96L92 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX27Q96L92 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX27Q96L92 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX27Q96L92 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNX27Q96L92 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX27Q96L92 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX27Q96L92 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNX27Q96L92 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX27Q96L92 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX27Q96L92 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNX27Q96L92 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX27Q96L92 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX27Q96L92 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SNX27Q96L92 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNX27Q96L92 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX27Q96L92 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX27Q96L92 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX27Q96L92 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNX27Q96L92 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX27Q96L92 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNX27Q96L92 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX27Q96L92 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX27Q96L92 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX27Q96L92 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNX27Q96L92 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX27Q96L92 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX27Q96L92 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX27Q96L92 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNX27Q96L92 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNX27Q96L92 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNX27Q96L92 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNX27Q96L92 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SNX27Q96L92 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNX27Q96L92 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX27Q96L92 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SNX27Q96L92 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX27Q96L92 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNX27Q96L92 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX27Q96L92 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX27Q96L92 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX27Q96L92 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX27Q96L92 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX27Q96L92 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNX27Q96L92 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNX27Q96L92 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SNX27Q96L92 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SNX27Q96L92 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNX27Q96L92 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms