Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
SNX27Q96L92 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SNX27Q96L92 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
SNX27Q96L92 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SNX27Q96L92 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SNX27Q96L92 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SNX27Q96L92 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
SNX27Q96L92 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SNX27Q96L92 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SNX27Q96L92 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
SNX27Q96L92 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SNX27Q96L92 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
SNX27Q96L92 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SNX27Q96L92 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SNX27Q96L92 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SNX27Q96L92 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SNX27Q96L92 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SNX27Q96L92 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SNX27Q96L92 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SNX27Q96L92 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SNX27Q96L92 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SNX27Q96L92 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
SNX27Q96L92 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SNX27Q96L92 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SNX27Q96L92 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SNX27Q96L92 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SNX27Q96L92 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SNX27Q96L92 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
SNX27Q96L92 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
SNX27Q96L92 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SNX27Q96L92 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SNX27Q96L92 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SNX27Q96L92 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SNX27Q96L92 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
SNX27Q96L92 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SNX27Q96L92 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SNX27Q96L92 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SNX27Q96L92 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SNX27Q96L92 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SNX27Q96L92 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SNX27Q96L92 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SNX27Q96L92 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
SNX27Q96L92 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SNX27Q96L92 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SNX27Q96L92 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
SNX27Q96L92 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
SNX27Q96L92 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SNX27Q96L92 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
SNX27Q96L92 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SNX27Q96L92 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
SNX27Q96L92 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SNX27Q96L92 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SNX27Q96L92 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SNX27Q96L92 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SNX27Q96L92 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SNX27Q96L92 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SNX27Q96L92 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
SNX27Q96L92 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
SNX27Q96L92 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
SNX27Q96L92 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
SNX27Q96L92 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
SNX27Q96L92 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SNX27Q96L92 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SNX27Q96L92 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SNX27Q96L92 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SNX27Q96L92 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SNX27Q96L92 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SNX27Q96L92 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SNX27Q96L92 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SNX27Q96L92 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
SNX27Q96L92 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SNX27Q96L92 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SNX27Q96L92 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
SNX27Q96L92 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SNX27Q96L92 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SNX27Q96L92 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SNX27Q96L92 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SNX27Q96L92 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SNX27Q96L92 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
SNX27Q96L92 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SNX27Q96L92 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SNX27Q96L92 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SNX27Q96L92 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SNX27Q96L92 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SNX27Q96L92 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
SNX27Q96L92 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SNX27Q96L92 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SNX27Q96L92 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SNX27Q96L92 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SNX27Q96L92 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
SNX27Q96L92 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SNX27Q96L92 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SNX27Q96L92 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SNX27Q96L92 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SNX27Q96L92 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SNX27Q96L92 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SNX27Q96L92 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SNX27Q96L92 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SNX27Q96L92 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
SNX27Q96L92 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms