Protein–RNA interactions for Protein: Q96KH6

C18orf12, Uncharacterized protein C18orf12, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf12Q96KH6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C18orf12Q96KH6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf12Q96KH6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C18orf12Q96KH6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C18orf12Q96KH6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C18orf12Q96KH6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C18orf12Q96KH6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf12Q96KH6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf12Q96KH6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf12Q96KH6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf12Q96KH6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf12Q96KH6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C18orf12Q96KH6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C18orf12Q96KH6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C18orf12Q96KH6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C18orf12Q96KH6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C18orf12Q96KH6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C18orf12Q96KH6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C18orf12Q96KH6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C18orf12Q96KH6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C18orf12Q96KH6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C18orf12Q96KH6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C18orf12Q96KH6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C18orf12Q96KH6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C18orf12Q96KH6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C18orf12Q96KH6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C18orf12Q96KH6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C18orf12Q96KH6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C18orf12Q96KH6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C18orf12Q96KH6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C18orf12Q96KH6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C18orf12Q96KH6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C18orf12Q96KH6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C18orf12Q96KH6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C18orf12Q96KH6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C18orf12Q96KH6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C18orf12Q96KH6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C18orf12Q96KH6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C18orf12Q96KH6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C18orf12Q96KH6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C18orf12Q96KH6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf12Q96KH6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf12Q96KH6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf12Q96KH6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf12Q96KH6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C18orf12Q96KH6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf12Q96KH6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C18orf12Q96KH6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf12Q96KH6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf12Q96KH6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf12Q96KH6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C18orf12Q96KH6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf12Q96KH6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf12Q96KH6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf12Q96KH6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf12Q96KH6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C18orf12Q96KH6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf12Q96KH6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf12Q96KH6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf12Q96KH6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf12Q96KH6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf12Q96KH6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf12Q96KH6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf12Q96KH6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf12Q96KH6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf12Q96KH6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C18orf12Q96KH6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms