Protein–RNA interactions for Protein: Q96A59

MARVELD3, MARVEL domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARVELD3Q96A59 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARVELD3Q96A59 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARVELD3Q96A59 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MARVELD3Q96A59 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARVELD3Q96A59 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARVELD3Q96A59 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARVELD3Q96A59 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MARVELD3Q96A59 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARVELD3Q96A59 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARVELD3Q96A59 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARVELD3Q96A59 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARVELD3Q96A59 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARVELD3Q96A59 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MARVELD3Q96A59 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARVELD3Q96A59 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MARVELD3Q96A59 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
MARVELD3Q96A59 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MARVELD3Q96A59 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
MARVELD3Q96A59 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MARVELD3Q96A59 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARVELD3Q96A59 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARVELD3Q96A59 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARVELD3Q96A59 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARVELD3Q96A59 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARVELD3Q96A59 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARVELD3Q96A59 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MARVELD3Q96A59 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARVELD3Q96A59 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARVELD3Q96A59 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MARVELD3Q96A59 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARVELD3Q96A59 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARVELD3Q96A59 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MARVELD3Q96A59 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARVELD3Q96A59 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARVELD3Q96A59 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MARVELD3Q96A59 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MARVELD3Q96A59 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MARVELD3Q96A59 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MARVELD3Q96A59 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MARVELD3Q96A59 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MARVELD3Q96A59 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARVELD3Q96A59 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARVELD3Q96A59 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MARVELD3Q96A59 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARVELD3Q96A59 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MARVELD3Q96A59 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARVELD3Q96A59 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARVELD3Q96A59 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MARVELD3Q96A59 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARVELD3Q96A59 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARVELD3Q96A59 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MARVELD3Q96A59 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARVELD3Q96A59 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARVELD3Q96A59 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARVELD3Q96A59 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MARVELD3Q96A59 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARVELD3Q96A59 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARVELD3Q96A59 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARVELD3Q96A59 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MARVELD3Q96A59 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARVELD3Q96A59 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARVELD3Q96A59 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MARVELD3Q96A59 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARVELD3Q96A59 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MARVELD3Q96A59 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARVELD3Q96A59 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARVELD3Q96A59 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARVELD3Q96A59 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARVELD3Q96A59 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MARVELD3Q96A59 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MARVELD3Q96A59 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARVELD3Q96A59 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARVELD3Q96A59 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARVELD3Q96A59 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARVELD3Q96A59 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MARVELD3Q96A59 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARVELD3Q96A59 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARVELD3Q96A59 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARVELD3Q96A59 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARVELD3Q96A59 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARVELD3Q96A59 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MARVELD3Q96A59 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARVELD3Q96A59 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MARVELD3Q96A59 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARVELD3Q96A59 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARVELD3Q96A59 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARVELD3Q96A59 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MARVELD3Q96A59 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARVELD3Q96A59 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARVELD3Q96A59 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARVELD3Q96A59 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARVELD3Q96A59 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MARVELD3Q96A59 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARVELD3Q96A59 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARVELD3Q96A59 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARVELD3Q96A59 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MARVELD3Q96A59 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARVELD3Q96A59 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARVELD3Q96A59 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MARVELD3Q96A59 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms