Protein–RNA interactions for Protein: Q96A59

MARVELD3, MARVEL domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARVELD3Q96A59 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MARVELD3Q96A59 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MARVELD3Q96A59 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MARVELD3Q96A59 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MARVELD3Q96A59 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MARVELD3Q96A59 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MARVELD3Q96A59 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MARVELD3Q96A59 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MARVELD3Q96A59 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MARVELD3Q96A59 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MARVELD3Q96A59 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MARVELD3Q96A59 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MARVELD3Q96A59 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MARVELD3Q96A59 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MARVELD3Q96A59 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MARVELD3Q96A59 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MARVELD3Q96A59 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MARVELD3Q96A59 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MARVELD3Q96A59 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MARVELD3Q96A59 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MARVELD3Q96A59 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MARVELD3Q96A59 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MARVELD3Q96A59 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MARVELD3Q96A59 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MARVELD3Q96A59 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MARVELD3Q96A59 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MARVELD3Q96A59 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MARVELD3Q96A59 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MARVELD3Q96A59 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MARVELD3Q96A59 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MARVELD3Q96A59 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MARVELD3Q96A59 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MARVELD3Q96A59 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MARVELD3Q96A59 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MARVELD3Q96A59 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MARVELD3Q96A59 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MARVELD3Q96A59 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MARVELD3Q96A59 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MARVELD3Q96A59 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MARVELD3Q96A59 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MARVELD3Q96A59 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MARVELD3Q96A59 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MARVELD3Q96A59 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MARVELD3Q96A59 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MARVELD3Q96A59 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MARVELD3Q96A59 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MARVELD3Q96A59 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MARVELD3Q96A59 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MARVELD3Q96A59 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MARVELD3Q96A59 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MARVELD3Q96A59 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MARVELD3Q96A59 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MARVELD3Q96A59 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MARVELD3Q96A59 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MARVELD3Q96A59 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MARVELD3Q96A59 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MARVELD3Q96A59 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MARVELD3Q96A59 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MARVELD3Q96A59 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MARVELD3Q96A59 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MARVELD3Q96A59 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MARVELD3Q96A59 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MARVELD3Q96A59 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MARVELD3Q96A59 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MARVELD3Q96A59 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARVELD3Q96A59 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARVELD3Q96A59 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARVELD3Q96A59 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARVELD3Q96A59 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARVELD3Q96A59 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARVELD3Q96A59 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARVELD3Q96A59 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MARVELD3Q96A59 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARVELD3Q96A59 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARVELD3Q96A59 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARVELD3Q96A59 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARVELD3Q96A59 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARVELD3Q96A59 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARVELD3Q96A59 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MARVELD3Q96A59 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MARVELD3Q96A59 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARVELD3Q96A59 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARVELD3Q96A59 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MARVELD3Q96A59 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MARVELD3Q96A59 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MARVELD3Q96A59 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MARVELD3Q96A59 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MARVELD3Q96A59 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MARVELD3Q96A59 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MARVELD3Q96A59 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARVELD3Q96A59 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARVELD3Q96A59 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MARVELD3Q96A59 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARVELD3Q96A59 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MARVELD3Q96A59 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MARVELD3Q96A59 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARVELD3Q96A59 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MARVELD3Q96A59 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MARVELD3Q96A59 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARVELD3Q96A59 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms