Protein–RNA interactions for Protein: Q96A59

MARVELD3, MARVEL domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARVELD3Q96A59 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
MARVELD3Q96A59 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
MARVELD3Q96A59 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MARVELD3Q96A59 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MARVELD3Q96A59 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MARVELD3Q96A59 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MARVELD3Q96A59 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MARVELD3Q96A59 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MARVELD3Q96A59 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
MARVELD3Q96A59 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MARVELD3Q96A59 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MARVELD3Q96A59 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MARVELD3Q96A59 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MARVELD3Q96A59 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MARVELD3Q96A59 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MARVELD3Q96A59 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MARVELD3Q96A59 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MARVELD3Q96A59 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MARVELD3Q96A59 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MARVELD3Q96A59 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MARVELD3Q96A59 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MARVELD3Q96A59 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MARVELD3Q96A59 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MARVELD3Q96A59 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MARVELD3Q96A59 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MARVELD3Q96A59 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
MARVELD3Q96A59 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MARVELD3Q96A59 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MARVELD3Q96A59 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MARVELD3Q96A59 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
MARVELD3Q96A59 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MARVELD3Q96A59 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
MARVELD3Q96A59 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MARVELD3Q96A59 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MARVELD3Q96A59 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MARVELD3Q96A59 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MARVELD3Q96A59 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MARVELD3Q96A59 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MARVELD3Q96A59 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MARVELD3Q96A59 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MARVELD3Q96A59 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MARVELD3Q96A59 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MARVELD3Q96A59 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MARVELD3Q96A59 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MARVELD3Q96A59 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MARVELD3Q96A59 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MARVELD3Q96A59 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MARVELD3Q96A59 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MARVELD3Q96A59 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MARVELD3Q96A59 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MARVELD3Q96A59 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MARVELD3Q96A59 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MARVELD3Q96A59 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MARVELD3Q96A59 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MARVELD3Q96A59 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MARVELD3Q96A59 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MARVELD3Q96A59 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MARVELD3Q96A59 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MARVELD3Q96A59 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MARVELD3Q96A59 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MARVELD3Q96A59 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MARVELD3Q96A59 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MARVELD3Q96A59 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MARVELD3Q96A59 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MARVELD3Q96A59 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARVELD3Q96A59 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARVELD3Q96A59 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARVELD3Q96A59 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARVELD3Q96A59 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARVELD3Q96A59 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARVELD3Q96A59 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARVELD3Q96A59 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MARVELD3Q96A59 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARVELD3Q96A59 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARVELD3Q96A59 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARVELD3Q96A59 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARVELD3Q96A59 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MARVELD3Q96A59 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MARVELD3Q96A59 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MARVELD3Q96A59 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MARVELD3Q96A59 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARVELD3Q96A59 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MARVELD3Q96A59 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MARVELD3Q96A59 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
MARVELD3Q96A59 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
MARVELD3Q96A59 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MARVELD3Q96A59 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MARVELD3Q96A59 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MARVELD3Q96A59 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MARVELD3Q96A59 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARVELD3Q96A59 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MARVELD3Q96A59 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MARVELD3Q96A59 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MARVELD3Q96A59 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MARVELD3Q96A59 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MARVELD3Q96A59 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MARVELD3Q96A59 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MARVELD3Q96A59 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MARVELD3Q96A59 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MARVELD3Q96A59 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms