Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVE6

TMEM171, Transmembrane protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM171Q8WVE6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM171Q8WVE6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM171Q8WVE6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM171Q8WVE6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM171Q8WVE6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM171Q8WVE6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM171Q8WVE6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM171Q8WVE6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM171Q8WVE6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM171Q8WVE6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM171Q8WVE6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM171Q8WVE6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM171Q8WVE6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM171Q8WVE6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM171Q8WVE6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM171Q8WVE6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM171Q8WVE6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM171Q8WVE6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM171Q8WVE6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM171Q8WVE6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM171Q8WVE6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM171Q8WVE6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM171Q8WVE6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM171Q8WVE6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM171Q8WVE6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM171Q8WVE6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM171Q8WVE6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM171Q8WVE6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM171Q8WVE6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM171Q8WVE6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM171Q8WVE6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM171Q8WVE6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM171Q8WVE6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM171Q8WVE6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM171Q8WVE6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM171Q8WVE6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM171Q8WVE6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM171Q8WVE6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM171Q8WVE6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM171Q8WVE6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM171Q8WVE6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM171Q8WVE6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM171Q8WVE6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms