Protein–RNA interactions for Protein: P54851

EMP2, Epithelial membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP2P54851 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EMP2P54851 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMP2P54851 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMP2P54851 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMP2P54851 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EMP2P54851 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMP2P54851 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMP2P54851 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMP2P54851 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMP2P54851 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMP2P54851 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EMP2P54851 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMP2P54851 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMP2P54851 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMP2P54851 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EMP2P54851 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EMP2P54851 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
EMP2P54851 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EMP2P54851 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EMP2P54851 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMP2P54851 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMP2P54851 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EMP2P54851 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMP2P54851 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMP2P54851 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EMP2P54851 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMP2P54851 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMP2P54851 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMP2P54851 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EMP2P54851 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMP2P54851 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMP2P54851 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMP2P54851 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EMP2P54851 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMP2P54851 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMP2P54851 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMP2P54851 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMP2P54851 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EMP2P54851 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMP2P54851 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMP2P54851 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMP2P54851 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EMP2P54851 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EMP2P54851 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EMP2P54851 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EMP2P54851 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EMP2P54851 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EMP2P54851 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EMP2P54851 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMP2P54851 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMP2P54851 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMP2P54851 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMP2P54851 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMP2P54851 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMP2P54851 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EMP2P54851 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMP2P54851 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMP2P54851 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMP2P54851 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EMP2P54851 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EMP2P54851 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
EMP2P54851 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EMP2P54851 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMP2P54851 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMP2P54851 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMP2P54851 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMP2P54851 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMP2P54851 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMP2P54851 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMP2P54851 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMP2P54851 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMP2P54851 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMP2P54851 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMP2P54851 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMP2P54851 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMP2P54851 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMP2P54851 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMP2P54851 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMP2P54851 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMP2P54851 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EMP2P54851 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EMP2P54851 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EMP2P54851 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EMP2P54851 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EMP2P54851 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMP2P54851 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMP2P54851 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMP2P54851 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMP2P54851 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMP2P54851 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMP2P54851 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EMP2P54851 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EMP2P54851 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EMP2P54851 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EMP2P54851 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EMP2P54851 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMP2P54851 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMP2P54851 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EMP2P54851 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMP2P54851 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms