Protein–RNA interactions for Protein: P54098

POLG, DNA polymerase subunit gamma-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLGP54098 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLGP54098 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
POLGP54098 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLGP54098 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLGP54098 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLGP54098 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
POLGP54098 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
POLGP54098 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLGP54098 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLGP54098 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLGP54098 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLGP54098 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLGP54098 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLGP54098 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLGP54098 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLGP54098 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLGP54098 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLGP54098 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLGP54098 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLGP54098 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLGP54098 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLGP54098 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
POLGP54098 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLGP54098 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLGP54098 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLGP54098 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLGP54098 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLGP54098 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLGP54098 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLGP54098 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLGP54098 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLGP54098 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLGP54098 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLGP54098 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLGP54098 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLGP54098 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLGP54098 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLGP54098 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLGP54098 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLGP54098 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLGP54098 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
POLGP54098 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
POLGP54098 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POLGP54098 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLGP54098 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLGP54098 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
POLGP54098 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLGP54098 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLGP54098 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLGP54098 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
POLGP54098 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
POLGP54098 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLGP54098 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLGP54098 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLGP54098 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLGP54098 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POLGP54098 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLGP54098 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POLGP54098 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLGP54098 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLGP54098 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
POLGP54098 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLGP54098 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POLGP54098 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
POLGP54098 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POLGP54098 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLGP54098 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POLGP54098 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLGP54098 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLGP54098 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLGP54098 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLGP54098 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLGP54098 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLGP54098 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLGP54098 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLGP54098 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLGP54098 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLGP54098 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLGP54098 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLGP54098 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLGP54098 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLGP54098 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLGP54098 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
POLGP54098 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLGP54098 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLGP54098 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLGP54098 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLGP54098 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLGP54098 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLGP54098 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLGP54098 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLGP54098 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLGP54098 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLGP54098 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLGP54098 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLGP54098 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLGP54098 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLGP54098 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLGP54098 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLGP54098 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms