Protein–RNA interactions for Protein: P43234

CTSO, Cathepsin O, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSOP43234 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CTSOP43234 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTSOP43234 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTSOP43234 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTSOP43234 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTSOP43234 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTSOP43234 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTSOP43234 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTSOP43234 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTSOP43234 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTSOP43234 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTSOP43234 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTSOP43234 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTSOP43234 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTSOP43234 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTSOP43234 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTSOP43234 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTSOP43234 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTSOP43234 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTSOP43234 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTSOP43234 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CTSOP43234 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTSOP43234 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTSOP43234 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTSOP43234 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTSOP43234 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTSOP43234 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTSOP43234 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTSOP43234 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTSOP43234 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTSOP43234 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTSOP43234 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CTSOP43234 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTSOP43234 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTSOP43234 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTSOP43234 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTSOP43234 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTSOP43234 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTSOP43234 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTSOP43234 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTSOP43234 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTSOP43234 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTSOP43234 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTSOP43234 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTSOP43234 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTSOP43234 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTSOP43234 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTSOP43234 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTSOP43234 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTSOP43234 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CTSOP43234 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTSOP43234 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTSOP43234 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTSOP43234 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTSOP43234 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTSOP43234 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTSOP43234 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTSOP43234 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTSOP43234 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTSOP43234 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTSOP43234 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CTSOP43234 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CTSOP43234 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTSOP43234 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTSOP43234 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTSOP43234 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTSOP43234 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTSOP43234 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTSOP43234 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTSOP43234 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTSOP43234 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTSOP43234 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTSOP43234 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTSOP43234 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTSOP43234 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTSOP43234 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTSOP43234 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CTSOP43234 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTSOP43234 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTSOP43234 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTSOP43234 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTSOP43234 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CTSOP43234 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTSOP43234 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTSOP43234 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTSOP43234 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTSOP43234 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTSOP43234 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CTSOP43234 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTSOP43234 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTSOP43234 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTSOP43234 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTSOP43234 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTSOP43234 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTSOP43234 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTSOP43234 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTSOP43234 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTSOP43234 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTSOP43234 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTSOP43234 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms