Protein–RNA interactions for Protein: P0C881

RSPH10B, Radial spoke head 10 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH10BP0C881 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RSPH10BP0C881 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RSPH10BP0C881 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RSPH10BP0C881 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RSPH10BP0C881 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RSPH10BP0C881 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RSPH10BP0C881 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RSPH10BP0C881 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RSPH10BP0C881 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RSPH10BP0C881 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RSPH10BP0C881 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RSPH10BP0C881 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RSPH10BP0C881 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RSPH10BP0C881 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RSPH10BP0C881 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RSPH10BP0C881 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RSPH10BP0C881 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RSPH10BP0C881 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RSPH10BP0C881 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPH10BP0C881 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPH10BP0C881 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPH10BP0C881 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPH10BP0C881 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RSPH10BP0C881 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RSPH10BP0C881 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RSPH10BP0C881 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RSPH10BP0C881 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RSPH10BP0C881 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RSPH10BP0C881 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RSPH10BP0C881 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RSPH10BP0C881 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RSPH10BP0C881 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RSPH10BP0C881 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RSPH10BP0C881 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RSPH10BP0C881 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RSPH10BP0C881 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH10BP0C881 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH10BP0C881 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RSPH10BP0C881 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RSPH10BP0C881 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH10BP0C881 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH10BP0C881 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH10BP0C881 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH10BP0C881 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RSPH10BP0C881 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RSPH10BP0C881 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RSPH10BP0C881 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RSPH10BP0C881 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RSPH10BP0C881 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RSPH10BP0C881 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH10BP0C881 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH10BP0C881 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RSPH10BP0C881 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RSPH10BP0C881 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RSPH10BP0C881 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RSPH10BP0C881 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RSPH10BP0C881 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RSPH10BP0C881 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RSPH10BP0C881 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RSPH10BP0C881 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RSPH10BP0C881 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RSPH10BP0C881 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH10BP0C881 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RSPH10BP0C881 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPH10BP0C881 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPH10BP0C881 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RSPH10BP0C881 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RSPH10BP0C881 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RSPH10BP0C881 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RSPH10BP0C881 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RSPH10BP0C881 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RSPH10BP0C881 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RSPH10BP0C881 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RSPH10BP0C881 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RSPH10BP0C881 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RSPH10BP0C881 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RSPH10BP0C881 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RSPH10BP0C881 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RSPH10BP0C881 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RSPH10BP0C881 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RSPH10BP0C881 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RSPH10BP0C881 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RSPH10BP0C881 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RSPH10BP0C881 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RSPH10BP0C881 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RSPH10BP0C881 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RSPH10BP0C881 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RSPH10BP0C881 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RSPH10BP0C881 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RSPH10BP0C881 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RSPH10BP0C881 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RSPH10BP0C881 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RSPH10BP0C881 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RSPH10BP0C881 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RSPH10BP0C881 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RSPH10BP0C881 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RSPH10BP0C881 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RSPH10BP0C881 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RSPH10BP0C881 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RSPH10BP0C881 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms