Protein–RNA interactions for Protein: O15027

SEC16A, Protein transport protein Sec16A, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16AO15027 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC16AO15027 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEC16AO15027 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC16AO15027 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC16AO15027 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEC16AO15027 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEC16AO15027 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEC16AO15027 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC16AO15027 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC16AO15027 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEC16AO15027 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC16AO15027 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC16AO15027 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC16AO15027 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEC16AO15027 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC16AO15027 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC16AO15027 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEC16AO15027 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEC16AO15027 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC16AO15027 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEC16AO15027 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEC16AO15027 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC16AO15027 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC16AO15027 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC16AO15027 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC16AO15027 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEC16AO15027 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC16AO15027 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC16AO15027 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SEC16AO15027 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC16AO15027 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC16AO15027 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SEC16AO15027 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC16AO15027 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC16AO15027 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC16AO15027 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC16AO15027 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC16AO15027 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC16AO15027 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SEC16AO15027 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC16AO15027 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC16AO15027 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC16AO15027 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC16AO15027 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC16AO15027 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC16AO15027 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SEC16AO15027 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC16AO15027 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC16AO15027 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC16AO15027 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC16AO15027 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC16AO15027 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SEC16AO15027 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC16AO15027 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC16AO15027 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC16AO15027 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC16AO15027 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC16AO15027 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SEC16AO15027 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC16AO15027 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SEC16AO15027 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC16AO15027 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC16AO15027 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SEC16AO15027 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SEC16AO15027 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SEC16AO15027 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SEC16AO15027 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms