Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GIPC1O14908 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GIPC1O14908 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GIPC1O14908 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GIPC1O14908 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GIPC1O14908 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GIPC1O14908 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GIPC1O14908 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GIPC1O14908 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GIPC1O14908 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GIPC1O14908 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GIPC1O14908 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GIPC1O14908 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GIPC1O14908 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GIPC1O14908 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GIPC1O14908 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GIPC1O14908 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GIPC1O14908 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GIPC1O14908 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GIPC1O14908 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GIPC1O14908 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GIPC1O14908 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GIPC1O14908 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GIPC1O14908 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GIPC1O14908 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GIPC1O14908 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GIPC1O14908 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GIPC1O14908 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GIPC1O14908 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GIPC1O14908 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GIPC1O14908 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GIPC1O14908 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GIPC1O14908 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GIPC1O14908 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GIPC1O14908 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GIPC1O14908 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GIPC1O14908 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GIPC1O14908 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GIPC1O14908 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GIPC1O14908 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GIPC1O14908 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GIPC1O14908 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GIPC1O14908 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GIPC1O14908 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GIPC1O14908 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GIPC1O14908 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GIPC1O14908 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GIPC1O14908 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GIPC1O14908 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GIPC1O14908 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GIPC1O14908 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GIPC1O14908 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GIPC1O14908 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GIPC1O14908 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GIPC1O14908 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GIPC1O14908 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GIPC1O14908 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GIPC1O14908 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GIPC1O14908 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GIPC1O14908 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GIPC1O14908 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GIPC1O14908 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GIPC1O14908 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GIPC1O14908 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GIPC1O14908 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GIPC1O14908 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GIPC1O14908 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GIPC1O14908 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms