Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GFRA2O00451 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GFRA2O00451 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GFRA2O00451 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GFRA2O00451 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GFRA2O00451 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GFRA2O00451 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GFRA2O00451 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GFRA2O00451 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GFRA2O00451 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GFRA2O00451 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GFRA2O00451 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GFRA2O00451 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GFRA2O00451 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GFRA2O00451 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GFRA2O00451 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GFRA2O00451 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GFRA2O00451 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GFRA2O00451 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GFRA2O00451 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GFRA2O00451 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GFRA2O00451 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GFRA2O00451 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GFRA2O00451 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GFRA2O00451 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GFRA2O00451 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GFRA2O00451 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GFRA2O00451 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GFRA2O00451 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GFRA2O00451 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GFRA2O00451 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GFRA2O00451 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GFRA2O00451 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GFRA2O00451 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GFRA2O00451 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GFRA2O00451 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GFRA2O00451 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GFRA2O00451 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GFRA2O00451 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GFRA2O00451 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GFRA2O00451 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GFRA2O00451 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GFRA2O00451 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GFRA2O00451 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GFRA2O00451 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GFRA2O00451 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GFRA2O00451 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GFRA2O00451 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GFRA2O00451 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GFRA2O00451 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GFRA2O00451 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GFRA2O00451 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GFRA2O00451 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GFRA2O00451 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GFRA2O00451 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GFRA2O00451 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GFRA2O00451 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GFRA2O00451 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GFRA2O00451 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
GFRA2O00451 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GFRA2O00451 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
GFRA2O00451 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GFRA2O00451 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GFRA2O00451 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GFRA2O00451 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GFRA2O00451 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GFRA2O00451 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GFRA2O00451 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GFRA2O00451 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GFRA2O00451 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms