Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
GFRA2O00451 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
GFRA2O00451 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
GFRA2O00451 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
GFRA2O00451 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
GFRA2O00451 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GFRA2O00451 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
GFRA2O00451 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
GFRA2O00451 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
GFRA2O00451 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
GFRA2O00451 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
GFRA2O00451 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
GFRA2O00451 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
GFRA2O00451 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GFRA2O00451 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
GFRA2O00451 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
GFRA2O00451 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
GFRA2O00451 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
GFRA2O00451 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GFRA2O00451 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GFRA2O00451 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
GFRA2O00451 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GFRA2O00451 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GFRA2O00451 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GFRA2O00451 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
GFRA2O00451 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GFRA2O00451 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GFRA2O00451 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
GFRA2O00451 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
GFRA2O00451 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
GFRA2O00451 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GFRA2O00451 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
GFRA2O00451 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GFRA2O00451 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GFRA2O00451 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
GFRA2O00451 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GFRA2O00451 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GFRA2O00451 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GFRA2O00451 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
GFRA2O00451 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
GFRA2O00451 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
GFRA2O00451 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GFRA2O00451 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GFRA2O00451 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
GFRA2O00451 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GFRA2O00451 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
GFRA2O00451 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GFRA2O00451 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GFRA2O00451 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GFRA2O00451 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
GFRA2O00451 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
GFRA2O00451 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GFRA2O00451 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
GFRA2O00451 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GFRA2O00451 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GFRA2O00451 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GFRA2O00451 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GFRA2O00451 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GFRA2O00451 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GFRA2O00451 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GFRA2O00451 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GFRA2O00451 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GFRA2O00451 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GFRA2O00451 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GFRA2O00451 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GFRA2O00451 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GFRA2O00451 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
GFRA2O00451 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
GFRA2O00451 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GFRA2O00451 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GFRA2O00451 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GFRA2O00451 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GFRA2O00451 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
GFRA2O00451 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GFRA2O00451 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GFRA2O00451 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GFRA2O00451 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GFRA2O00451 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GFRA2O00451 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GFRA2O00451 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GFRA2O00451 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GFRA2O00451 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
GFRA2O00451 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GFRA2O00451 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GFRA2O00451 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GFRA2O00451 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GFRA2O00451 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GFRA2O00451 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GFRA2O00451 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GFRA2O00451 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GFRA2O00451 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GFRA2O00451 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GFRA2O00451 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GFRA2O00451 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GFRA2O00451 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GFRA2O00451 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GFRA2O00451 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GFRA2O00451 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GFRA2O00451 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
GFRA2O00451 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms