Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B6

EMC9, ER membrane protein complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC9Q9Y3B6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EMC9Q9Y3B6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMC9Q9Y3B6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EMC9Q9Y3B6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMC9Q9Y3B6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMC9Q9Y3B6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EMC9Q9Y3B6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMC9Q9Y3B6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EMC9Q9Y3B6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EMC9Q9Y3B6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EMC9Q9Y3B6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EMC9Q9Y3B6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMC9Q9Y3B6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMC9Q9Y3B6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMC9Q9Y3B6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EMC9Q9Y3B6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMC9Q9Y3B6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EMC9Q9Y3B6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMC9Q9Y3B6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMC9Q9Y3B6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMC9Q9Y3B6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EMC9Q9Y3B6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EMC9Q9Y3B6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMC9Q9Y3B6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EMC9Q9Y3B6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EMC9Q9Y3B6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMC9Q9Y3B6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMC9Q9Y3B6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMC9Q9Y3B6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EMC9Q9Y3B6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMC9Q9Y3B6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EMC9Q9Y3B6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMC9Q9Y3B6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EMC9Q9Y3B6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMC9Q9Y3B6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMC9Q9Y3B6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMC9Q9Y3B6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMC9Q9Y3B6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EMC9Q9Y3B6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMC9Q9Y3B6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMC9Q9Y3B6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMC9Q9Y3B6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMC9Q9Y3B6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMC9Q9Y3B6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMC9Q9Y3B6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMC9Q9Y3B6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMC9Q9Y3B6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMC9Q9Y3B6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMC9Q9Y3B6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMC9Q9Y3B6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMC9Q9Y3B6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMC9Q9Y3B6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMC9Q9Y3B6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMC9Q9Y3B6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMC9Q9Y3B6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMC9Q9Y3B6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMC9Q9Y3B6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMC9Q9Y3B6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMC9Q9Y3B6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMC9Q9Y3B6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMC9Q9Y3B6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMC9Q9Y3B6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMC9Q9Y3B6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMC9Q9Y3B6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMC9Q9Y3B6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMC9Q9Y3B6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMC9Q9Y3B6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMC9Q9Y3B6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMC9Q9Y3B6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMC9Q9Y3B6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMC9Q9Y3B6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMC9Q9Y3B6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMC9Q9Y3B6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMC9Q9Y3B6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EMC9Q9Y3B6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMC9Q9Y3B6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMC9Q9Y3B6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMC9Q9Y3B6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMC9Q9Y3B6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMC9Q9Y3B6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMC9Q9Y3B6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMC9Q9Y3B6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMC9Q9Y3B6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMC9Q9Y3B6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EMC9Q9Y3B6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EMC9Q9Y3B6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMC9Q9Y3B6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMC9Q9Y3B6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMC9Q9Y3B6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMC9Q9Y3B6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMC9Q9Y3B6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMC9Q9Y3B6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMC9Q9Y3B6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMC9Q9Y3B6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMC9Q9Y3B6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMC9Q9Y3B6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EMC9Q9Y3B6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EMC9Q9Y3B6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EMC9Q9Y3B6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC9Q9Y3B6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms