Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NOP58Q9Y2X3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NOP58Q9Y2X3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NOP58Q9Y2X3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
NOP58Q9Y2X3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NOP58Q9Y2X3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NOP58Q9Y2X3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NOP58Q9Y2X3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NOP58Q9Y2X3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NOP58Q9Y2X3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NOP58Q9Y2X3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
NOP58Q9Y2X3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NOP58Q9Y2X3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NOP58Q9Y2X3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NOP58Q9Y2X3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NOP58Q9Y2X3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NOP58Q9Y2X3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NOP58Q9Y2X3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NOP58Q9Y2X3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NOP58Q9Y2X3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NOP58Q9Y2X3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NOP58Q9Y2X3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NOP58Q9Y2X3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NOP58Q9Y2X3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NOP58Q9Y2X3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NOP58Q9Y2X3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
NOP58Q9Y2X3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NOP58Q9Y2X3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NOP58Q9Y2X3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NOP58Q9Y2X3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NOP58Q9Y2X3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NOP58Q9Y2X3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NOP58Q9Y2X3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NOP58Q9Y2X3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NOP58Q9Y2X3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NOP58Q9Y2X3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NOP58Q9Y2X3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
NOP58Q9Y2X3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NOP58Q9Y2X3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NOP58Q9Y2X3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NOP58Q9Y2X3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NOP58Q9Y2X3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NOP58Q9Y2X3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
NOP58Q9Y2X3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NOP58Q9Y2X3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NOP58Q9Y2X3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NOP58Q9Y2X3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NOP58Q9Y2X3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NOP58Q9Y2X3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NOP58Q9Y2X3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NOP58Q9Y2X3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NOP58Q9Y2X3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NOP58Q9Y2X3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NOP58Q9Y2X3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NOP58Q9Y2X3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NOP58Q9Y2X3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NOP58Q9Y2X3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
NOP58Q9Y2X3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NOP58Q9Y2X3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NOP58Q9Y2X3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NOP58Q9Y2X3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NOP58Q9Y2X3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
NOP58Q9Y2X3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NOP58Q9Y2X3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NOP58Q9Y2X3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NOP58Q9Y2X3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NOP58Q9Y2X3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NOP58Q9Y2X3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NOP58Q9Y2X3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NOP58Q9Y2X3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NOP58Q9Y2X3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NOP58Q9Y2X3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NOP58Q9Y2X3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NOP58Q9Y2X3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NOP58Q9Y2X3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NOP58Q9Y2X3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NOP58Q9Y2X3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NOP58Q9Y2X3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NOP58Q9Y2X3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
NOP58Q9Y2X3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NOP58Q9Y2X3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NOP58Q9Y2X3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NOP58Q9Y2X3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NOP58Q9Y2X3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NOP58Q9Y2X3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NOP58Q9Y2X3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
NOP58Q9Y2X3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NOP58Q9Y2X3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NOP58Q9Y2X3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NOP58Q9Y2X3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NOP58Q9Y2X3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NOP58Q9Y2X3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NOP58Q9Y2X3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NOP58Q9Y2X3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
NOP58Q9Y2X3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NOP58Q9Y2X3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NOP58Q9Y2X3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NOP58Q9Y2X3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NOP58Q9Y2X3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NOP58Q9Y2X3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms