Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF6Q9Y252 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF6Q9Y252 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF6Q9Y252 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF6Q9Y252 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF6Q9Y252 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF6Q9Y252 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF6Q9Y252 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF6Q9Y252 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF6Q9Y252 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF6Q9Y252 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF6Q9Y252 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF6Q9Y252 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF6Q9Y252 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF6Q9Y252 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF6Q9Y252 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF6Q9Y252 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF6Q9Y252 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF6Q9Y252 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF6Q9Y252 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF6Q9Y252 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF6Q9Y252 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF6Q9Y252 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF6Q9Y252 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF6Q9Y252 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF6Q9Y252 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF6Q9Y252 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF6Q9Y252 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF6Q9Y252 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF6Q9Y252 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF6Q9Y252 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF6Q9Y252 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF6Q9Y252 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF6Q9Y252 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF6Q9Y252 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF6Q9Y252 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF6Q9Y252 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF6Q9Y252 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF6Q9Y252 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF6Q9Y252 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF6Q9Y252 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF6Q9Y252 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF6Q9Y252 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF6Q9Y252 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF6Q9Y252 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF6Q9Y252 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF6Q9Y252 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF6Q9Y252 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF6Q9Y252 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF6Q9Y252 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF6Q9Y252 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF6Q9Y252 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF6Q9Y252 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF6Q9Y252 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF6Q9Y252 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF6Q9Y252 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF6Q9Y252 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF6Q9Y252 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF6Q9Y252 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF6Q9Y252 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF6Q9Y252 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF6Q9Y252 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF6Q9Y252 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF6Q9Y252 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF6Q9Y252 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF6Q9Y252 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF6Q9Y252 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF6Q9Y252 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF6Q9Y252 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RNF6Q9Y252 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RNF6Q9Y252 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms