Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPUSD1Q9UJJ7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPUSD1Q9UJJ7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPUSD1Q9UJJ7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPUSD1Q9UJJ7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPUSD1Q9UJJ7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPUSD1Q9UJJ7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RPUSD1Q9UJJ7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPUSD1Q9UJJ7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPUSD1Q9UJJ7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPUSD1Q9UJJ7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPUSD1Q9UJJ7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPUSD1Q9UJJ7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPUSD1Q9UJJ7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPUSD1Q9UJJ7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPUSD1Q9UJJ7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPUSD1Q9UJJ7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPUSD1Q9UJJ7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPUSD1Q9UJJ7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPUSD1Q9UJJ7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPUSD1Q9UJJ7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPUSD1Q9UJJ7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPUSD1Q9UJJ7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPUSD1Q9UJJ7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPUSD1Q9UJJ7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPUSD1Q9UJJ7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPUSD1Q9UJJ7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RPUSD1Q9UJJ7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPUSD1Q9UJJ7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPUSD1Q9UJJ7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPUSD1Q9UJJ7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPUSD1Q9UJJ7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPUSD1Q9UJJ7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPUSD1Q9UJJ7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPUSD1Q9UJJ7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPUSD1Q9UJJ7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPUSD1Q9UJJ7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPUSD1Q9UJJ7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPUSD1Q9UJJ7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPUSD1Q9UJJ7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms