Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SARS2Q9NP81 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SARS2Q9NP81 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SARS2Q9NP81 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SARS2Q9NP81 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SARS2Q9NP81 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SARS2Q9NP81 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SARS2Q9NP81 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SARS2Q9NP81 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SARS2Q9NP81 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SARS2Q9NP81 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SARS2Q9NP81 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SARS2Q9NP81 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SARS2Q9NP81 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SARS2Q9NP81 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SARS2Q9NP81 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SARS2Q9NP81 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SARS2Q9NP81 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SARS2Q9NP81 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SARS2Q9NP81 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SARS2Q9NP81 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SARS2Q9NP81 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SARS2Q9NP81 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SARS2Q9NP81 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SARS2Q9NP81 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SARS2Q9NP81 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SARS2Q9NP81 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SARS2Q9NP81 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SARS2Q9NP81 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SARS2Q9NP81 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SARS2Q9NP81 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SARS2Q9NP81 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SARS2Q9NP81 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SARS2Q9NP81 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SARS2Q9NP81 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SARS2Q9NP81 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SARS2Q9NP81 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SARS2Q9NP81 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SARS2Q9NP81 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SARS2Q9NP81 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SARS2Q9NP81 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SARS2Q9NP81 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SARS2Q9NP81 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SARS2Q9NP81 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SARS2Q9NP81 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SARS2Q9NP81 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SARS2Q9NP81 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SARS2Q9NP81 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SARS2Q9NP81 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SARS2Q9NP81 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SARS2Q9NP81 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SARS2Q9NP81 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SARS2Q9NP81 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SARS2Q9NP81 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SARS2Q9NP81 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SARS2Q9NP81 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SARS2Q9NP81 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SARS2Q9NP81 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SARS2Q9NP81 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SARS2Q9NP81 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SARS2Q9NP81 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SARS2Q9NP81 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SARS2Q9NP81 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SARS2Q9NP81 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SARS2Q9NP81 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SARS2Q9NP81 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SARS2Q9NP81 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SARS2Q9NP81 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SARS2Q9NP81 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SARS2Q9NP81 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SARS2Q9NP81 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SARS2Q9NP81 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SARS2Q9NP81 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SARS2Q9NP81 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SARS2Q9NP81 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SARS2Q9NP81 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SARS2Q9NP81 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SARS2Q9NP81 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SARS2Q9NP81 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SARS2Q9NP81 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SARS2Q9NP81 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SARS2Q9NP81 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SARS2Q9NP81 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SARS2Q9NP81 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SARS2Q9NP81 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SARS2Q9NP81 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SARS2Q9NP81 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SARS2Q9NP81 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SARS2Q9NP81 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SARS2Q9NP81 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SARS2Q9NP81 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SARS2Q9NP81 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SARS2Q9NP81 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SARS2Q9NP81 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SARS2Q9NP81 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SARS2Q9NP81 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SARS2Q9NP81 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SARS2Q9NP81 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SARS2Q9NP81 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SARS2Q9NP81 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms