Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMYD3Q9H7B4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMYD3Q9H7B4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMYD3Q9H7B4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMYD3Q9H7B4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMYD3Q9H7B4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMYD3Q9H7B4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMYD3Q9H7B4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMYD3Q9H7B4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMYD3Q9H7B4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMYD3Q9H7B4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMYD3Q9H7B4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMYD3Q9H7B4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMYD3Q9H7B4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMYD3Q9H7B4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMYD3Q9H7B4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMYD3Q9H7B4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMYD3Q9H7B4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMYD3Q9H7B4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMYD3Q9H7B4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMYD3Q9H7B4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMYD3Q9H7B4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SMYD3Q9H7B4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMYD3Q9H7B4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMYD3Q9H7B4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMYD3Q9H7B4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMYD3Q9H7B4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMYD3Q9H7B4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMYD3Q9H7B4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMYD3Q9H7B4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMYD3Q9H7B4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMYD3Q9H7B4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMYD3Q9H7B4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMYD3Q9H7B4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMYD3Q9H7B4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMYD3Q9H7B4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMYD3Q9H7B4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SMYD3Q9H7B4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMYD3Q9H7B4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMYD3Q9H7B4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMYD3Q9H7B4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMYD3Q9H7B4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMYD3Q9H7B4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMYD3Q9H7B4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMYD3Q9H7B4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMYD3Q9H7B4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SMYD3Q9H7B4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMYD3Q9H7B4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMYD3Q9H7B4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMYD3Q9H7B4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMYD3Q9H7B4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMYD3Q9H7B4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMYD3Q9H7B4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMYD3Q9H7B4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMYD3Q9H7B4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SMYD3Q9H7B4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMYD3Q9H7B4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMYD3Q9H7B4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMYD3Q9H7B4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SMYD3Q9H7B4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMYD3Q9H7B4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMYD3Q9H7B4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMYD3Q9H7B4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMYD3Q9H7B4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMYD3Q9H7B4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMYD3Q9H7B4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SMYD3Q9H7B4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMYD3Q9H7B4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SMYD3Q9H7B4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMYD3Q9H7B4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SMYD3Q9H7B4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMYD3Q9H7B4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMYD3Q9H7B4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMYD3Q9H7B4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMYD3Q9H7B4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SMYD3Q9H7B4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SMYD3Q9H7B4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMYD3Q9H7B4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SMYD3Q9H7B4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMYD3Q9H7B4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMYD3Q9H7B4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMYD3Q9H7B4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMYD3Q9H7B4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMYD3Q9H7B4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMYD3Q9H7B4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMYD3Q9H7B4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMYD3Q9H7B4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMYD3Q9H7B4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMYD3Q9H7B4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMYD3Q9H7B4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMYD3Q9H7B4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMYD3Q9H7B4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SMYD3Q9H7B4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SMYD3Q9H7B4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SMYD3Q9H7B4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SMYD3Q9H7B4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMYD3Q9H7B4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMYD3Q9H7B4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMYD3Q9H7B4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SMYD3Q9H7B4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms