Protein–RNA interactions for Protein: Q9H649

NSUN3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN3Q9H649 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSUN3Q9H649 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NSUN3Q9H649 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NSUN3Q9H649 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NSUN3Q9H649 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NSUN3Q9H649 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NSUN3Q9H649 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NSUN3Q9H649 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NSUN3Q9H649 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NSUN3Q9H649 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NSUN3Q9H649 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSUN3Q9H649 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSUN3Q9H649 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NSUN3Q9H649 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NSUN3Q9H649 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NSUN3Q9H649 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NSUN3Q9H649 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NSUN3Q9H649 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NSUN3Q9H649 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NSUN3Q9H649 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NSUN3Q9H649 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NSUN3Q9H649 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
NSUN3Q9H649 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NSUN3Q9H649 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NSUN3Q9H649 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NSUN3Q9H649 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSUN3Q9H649 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSUN3Q9H649 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSUN3Q9H649 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NSUN3Q9H649 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSUN3Q9H649 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NSUN3Q9H649 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSUN3Q9H649 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSUN3Q9H649 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSUN3Q9H649 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSUN3Q9H649 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NSUN3Q9H649 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NSUN3Q9H649 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSUN3Q9H649 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSUN3Q9H649 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NSUN3Q9H649 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSUN3Q9H649 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSUN3Q9H649 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSUN3Q9H649 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSUN3Q9H649 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NSUN3Q9H649 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSUN3Q9H649 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSUN3Q9H649 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NSUN3Q9H649 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSUN3Q9H649 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSUN3Q9H649 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSUN3Q9H649 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NSUN3Q9H649 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
NSUN3Q9H649 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NSUN3Q9H649 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NSUN3Q9H649 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSUN3Q9H649 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSUN3Q9H649 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSUN3Q9H649 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSUN3Q9H649 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NSUN3Q9H649 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSUN3Q9H649 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSUN3Q9H649 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NSUN3Q9H649 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NSUN3Q9H649 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NSUN3Q9H649 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NSUN3Q9H649 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NSUN3Q9H649 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NSUN3Q9H649 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NSUN3Q9H649 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSUN3Q9H649 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NSUN3Q9H649 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NSUN3Q9H649 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
NSUN3Q9H649 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
NSUN3Q9H649 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSUN3Q9H649 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSUN3Q9H649 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSUN3Q9H649 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NSUN3Q9H649 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
NSUN3Q9H649 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSUN3Q9H649 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSUN3Q9H649 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSUN3Q9H649 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSUN3Q9H649 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NSUN3Q9H649 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSUN3Q9H649 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NSUN3Q9H649 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSUN3Q9H649 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NSUN3Q9H649 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NSUN3Q9H649 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NSUN3Q9H649 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NSUN3Q9H649 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NSUN3Q9H649 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NSUN3Q9H649 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NSUN3Q9H649 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NSUN3Q9H649 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NSUN3Q9H649 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NSUN3Q9H649 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NSUN3Q9H649 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NSUN3Q9H649 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms