Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3H1

TRIT1, tRNA dimethylallyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIT1Q9H3H1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIT1Q9H3H1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRIT1Q9H3H1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIT1Q9H3H1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIT1Q9H3H1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIT1Q9H3H1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRIT1Q9H3H1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRIT1Q9H3H1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIT1Q9H3H1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRIT1Q9H3H1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRIT1Q9H3H1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIT1Q9H3H1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIT1Q9H3H1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIT1Q9H3H1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRIT1Q9H3H1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIT1Q9H3H1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIT1Q9H3H1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIT1Q9H3H1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRIT1Q9H3H1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIT1Q9H3H1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIT1Q9H3H1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIT1Q9H3H1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRIT1Q9H3H1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIT1Q9H3H1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRIT1Q9H3H1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIT1Q9H3H1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIT1Q9H3H1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIT1Q9H3H1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRIT1Q9H3H1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIT1Q9H3H1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIT1Q9H3H1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIT1Q9H3H1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIT1Q9H3H1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIT1Q9H3H1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIT1Q9H3H1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIT1Q9H3H1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIT1Q9H3H1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIT1Q9H3H1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIT1Q9H3H1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIT1Q9H3H1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIT1Q9H3H1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIT1Q9H3H1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIT1Q9H3H1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIT1Q9H3H1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIT1Q9H3H1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIT1Q9H3H1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIT1Q9H3H1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIT1Q9H3H1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIT1Q9H3H1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIT1Q9H3H1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIT1Q9H3H1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIT1Q9H3H1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIT1Q9H3H1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIT1Q9H3H1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIT1Q9H3H1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIT1Q9H3H1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIT1Q9H3H1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIT1Q9H3H1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIT1Q9H3H1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIT1Q9H3H1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIT1Q9H3H1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIT1Q9H3H1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIT1Q9H3H1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIT1Q9H3H1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIT1Q9H3H1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIT1Q9H3H1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIT1Q9H3H1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIT1Q9H3H1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIT1Q9H3H1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIT1Q9H3H1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIT1Q9H3H1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIT1Q9H3H1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIT1Q9H3H1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIT1Q9H3H1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIT1Q9H3H1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRIT1Q9H3H1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIT1Q9H3H1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIT1Q9H3H1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIT1Q9H3H1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRIT1Q9H3H1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIT1Q9H3H1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIT1Q9H3H1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIT1Q9H3H1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIT1Q9H3H1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIT1Q9H3H1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIT1Q9H3H1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIT1Q9H3H1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRIT1Q9H3H1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIT1Q9H3H1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIT1Q9H3H1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIT1Q9H3H1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIT1Q9H3H1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIT1Q9H3H1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIT1Q9H3H1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIT1Q9H3H1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIT1Q9H3H1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIT1Q9H3H1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRIT1Q9H3H1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIT1Q9H3H1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRIT1Q9H3H1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms