Protein–RNA interactions for Protein: Q96G25

MED8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED8Q96G25 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED8Q96G25 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED8Q96G25 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED8Q96G25 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MED8Q96G25 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MED8Q96G25 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MED8Q96G25 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MED8Q96G25 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MED8Q96G25 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MED8Q96G25 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MED8Q96G25 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MED8Q96G25 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MED8Q96G25 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MED8Q96G25 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MED8Q96G25 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MED8Q96G25 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MED8Q96G25 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED8Q96G25 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED8Q96G25 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED8Q96G25 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED8Q96G25 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MED8Q96G25 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MED8Q96G25 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MED8Q96G25 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MED8Q96G25 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MED8Q96G25 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MED8Q96G25 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MED8Q96G25 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED8Q96G25 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED8Q96G25 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MED8Q96G25 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MED8Q96G25 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MED8Q96G25 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED8Q96G25 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED8Q96G25 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED8Q96G25 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MED8Q96G25 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED8Q96G25 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MED8Q96G25 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED8Q96G25 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED8Q96G25 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED8Q96G25 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED8Q96G25 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED8Q96G25 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MED8Q96G25 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED8Q96G25 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED8Q96G25 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MED8Q96G25 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED8Q96G25 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MED8Q96G25 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED8Q96G25 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MED8Q96G25 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MED8Q96G25 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED8Q96G25 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MED8Q96G25 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED8Q96G25 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MED8Q96G25 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED8Q96G25 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED8Q96G25 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED8Q96G25 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MED8Q96G25 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED8Q96G25 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MED8Q96G25 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MED8Q96G25 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MED8Q96G25 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MED8Q96G25 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MED8Q96G25 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED8Q96G25 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MED8Q96G25 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms