Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE4

FUBP1, Far upstream element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP1Q96AE4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FUBP1Q96AE4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FUBP1Q96AE4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FUBP1Q96AE4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FUBP1Q96AE4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FUBP1Q96AE4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FUBP1Q96AE4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FUBP1Q96AE4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FUBP1Q96AE4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FUBP1Q96AE4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FUBP1Q96AE4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FUBP1Q96AE4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FUBP1Q96AE4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FUBP1Q96AE4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FUBP1Q96AE4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
FUBP1Q96AE4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FUBP1Q96AE4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FUBP1Q96AE4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FUBP1Q96AE4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FUBP1Q96AE4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FUBP1Q96AE4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FUBP1Q96AE4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FUBP1Q96AE4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FUBP1Q96AE4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FUBP1Q96AE4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FUBP1Q96AE4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FUBP1Q96AE4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FUBP1Q96AE4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FUBP1Q96AE4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FUBP1Q96AE4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FUBP1Q96AE4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FUBP1Q96AE4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FUBP1Q96AE4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FUBP1Q96AE4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FUBP1Q96AE4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FUBP1Q96AE4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FUBP1Q96AE4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FUBP1Q96AE4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FUBP1Q96AE4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FUBP1Q96AE4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FUBP1Q96AE4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FUBP1Q96AE4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FUBP1Q96AE4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FUBP1Q96AE4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FUBP1Q96AE4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FUBP1Q96AE4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FUBP1Q96AE4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FUBP1Q96AE4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FUBP1Q96AE4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FUBP1Q96AE4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FUBP1Q96AE4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FUBP1Q96AE4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FUBP1Q96AE4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FUBP1Q96AE4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FUBP1Q96AE4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FUBP1Q96AE4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FUBP1Q96AE4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FUBP1Q96AE4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FUBP1Q96AE4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FUBP1Q96AE4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FUBP1Q96AE4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FUBP1Q96AE4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FUBP1Q96AE4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FUBP1Q96AE4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FUBP1Q96AE4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FUBP1Q96AE4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FUBP1Q96AE4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FUBP1Q96AE4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FUBP1Q96AE4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FUBP1Q96AE4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FUBP1Q96AE4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FUBP1Q96AE4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FUBP1Q96AE4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FUBP1Q96AE4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FUBP1Q96AE4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FUBP1Q96AE4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FUBP1Q96AE4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FUBP1Q96AE4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FUBP1Q96AE4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FUBP1Q96AE4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FUBP1Q96AE4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FUBP1Q96AE4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FUBP1Q96AE4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FUBP1Q96AE4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FUBP1Q96AE4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FUBP1Q96AE4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FUBP1Q96AE4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FUBP1Q96AE4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FUBP1Q96AE4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FUBP1Q96AE4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FUBP1Q96AE4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FUBP1Q96AE4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FUBP1Q96AE4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FUBP1Q96AE4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FUBP1Q96AE4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FUBP1Q96AE4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FUBP1Q96AE4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FUBP1Q96AE4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FUBP1Q96AE4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FUBP1Q96AE4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms