Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMPDL3AQ92484 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMPDL3AQ92484 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMPDL3AQ92484 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMPDL3AQ92484 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMPDL3AQ92484 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMPDL3AQ92484 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMPDL3AQ92484 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMPDL3AQ92484 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMPDL3AQ92484 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMPDL3AQ92484 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPDL3AQ92484 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPDL3AQ92484 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPDL3AQ92484 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMPDL3AQ92484 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMPDL3AQ92484 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMPDL3AQ92484 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMPDL3AQ92484 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMPDL3AQ92484 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SMPDL3AQ92484 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMPDL3AQ92484 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMPDL3AQ92484 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPDL3AQ92484 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPDL3AQ92484 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPDL3AQ92484 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPDL3AQ92484 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPDL3AQ92484 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMPDL3AQ92484 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMPDL3AQ92484 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMPDL3AQ92484 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMPDL3AQ92484 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMPDL3AQ92484 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMPDL3AQ92484 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMPDL3AQ92484 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMPDL3AQ92484 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMPDL3AQ92484 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMPDL3AQ92484 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMPDL3AQ92484 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMPDL3AQ92484 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMPDL3AQ92484 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMPDL3AQ92484 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMPDL3AQ92484 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMPDL3AQ92484 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMPDL3AQ92484 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMPDL3AQ92484 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMPDL3AQ92484 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMPDL3AQ92484 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMPDL3AQ92484 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMPDL3AQ92484 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMPDL3AQ92484 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMPDL3AQ92484 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMPDL3AQ92484 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMPDL3AQ92484 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SMPDL3AQ92484 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SMPDL3AQ92484 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPDL3AQ92484 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMPDL3AQ92484 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPDL3AQ92484 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPDL3AQ92484 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPDL3AQ92484 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPDL3AQ92484 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPDL3AQ92484 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPDL3AQ92484 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMPDL3AQ92484 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMPDL3AQ92484 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMPDL3AQ92484 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMPDL3AQ92484 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMPDL3AQ92484 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMPDL3AQ92484 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMPDL3AQ92484 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMPDL3AQ92484 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMPDL3AQ92484 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms