Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV35

LRRC29, Leucine-rich repeat-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC29Q8WV35 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LRRC29Q8WV35 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC29Q8WV35 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LRRC29Q8WV35 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC29Q8WV35 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LRRC29Q8WV35 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC29Q8WV35 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LRRC29Q8WV35 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC29Q8WV35 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC29Q8WV35 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC29Q8WV35 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC29Q8WV35 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC29Q8WV35 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LRRC29Q8WV35 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC29Q8WV35 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC29Q8WV35 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC29Q8WV35 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LRRC29Q8WV35 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC29Q8WV35 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC29Q8WV35 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRC29Q8WV35 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC29Q8WV35 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC29Q8WV35 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC29Q8WV35 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRC29Q8WV35 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC29Q8WV35 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC29Q8WV35 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRC29Q8WV35 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRC29Q8WV35 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC29Q8WV35 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC29Q8WV35 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC29Q8WV35 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRC29Q8WV35 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC29Q8WV35 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRC29Q8WV35 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC29Q8WV35 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC29Q8WV35 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC29Q8WV35 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC29Q8WV35 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC29Q8WV35 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRC29Q8WV35 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC29Q8WV35 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRC29Q8WV35 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC29Q8WV35 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRC29Q8WV35 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC29Q8WV35 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC29Q8WV35 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC29Q8WV35 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC29Q8WV35 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRC29Q8WV35 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC29Q8WV35 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC29Q8WV35 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC29Q8WV35 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC29Q8WV35 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRC29Q8WV35 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC29Q8WV35 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC29Q8WV35 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC29Q8WV35 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
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LRRC29Q8WV35 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRC29Q8WV35 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC29Q8WV35 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC29Q8WV35 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRC29Q8WV35 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRRC29Q8WV35 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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LRRC29Q8WV35 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRRC29Q8WV35 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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LRRC29Q8WV35 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRRC29Q8WV35 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC29Q8WV35 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC29Q8WV35 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRRC29Q8WV35 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC29Q8WV35 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC29Q8WV35 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC29Q8WV35 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRRC29Q8WV35 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC29Q8WV35 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC29Q8WV35 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC29Q8WV35 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRRC29Q8WV35 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC29Q8WV35 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC29Q8WV35 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC29Q8WV35 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC29Q8WV35 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC29Q8WV35 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC29Q8WV35 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC29Q8WV35 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC29Q8WV35 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC29Q8WV35 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC29Q8WV35 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
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