Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE85

GRHL3, Grainyhead-like protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL3Q8TE85 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRHL3Q8TE85 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRHL3Q8TE85 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRHL3Q8TE85 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRHL3Q8TE85 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRHL3Q8TE85 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRHL3Q8TE85 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRHL3Q8TE85 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRHL3Q8TE85 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRHL3Q8TE85 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRHL3Q8TE85 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GRHL3Q8TE85 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GRHL3Q8TE85 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GRHL3Q8TE85 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRHL3Q8TE85 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRHL3Q8TE85 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GRHL3Q8TE85 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRHL3Q8TE85 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRHL3Q8TE85 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRHL3Q8TE85 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRHL3Q8TE85 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRHL3Q8TE85 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRHL3Q8TE85 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GRHL3Q8TE85 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRHL3Q8TE85 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRHL3Q8TE85 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRHL3Q8TE85 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRHL3Q8TE85 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRHL3Q8TE85 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRHL3Q8TE85 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRHL3Q8TE85 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRHL3Q8TE85 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRHL3Q8TE85 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GRHL3Q8TE85 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRHL3Q8TE85 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRHL3Q8TE85 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRHL3Q8TE85 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRHL3Q8TE85 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRHL3Q8TE85 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRHL3Q8TE85 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GRHL3Q8TE85 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRHL3Q8TE85 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRHL3Q8TE85 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRHL3Q8TE85 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRHL3Q8TE85 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRHL3Q8TE85 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRHL3Q8TE85 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRHL3Q8TE85 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRHL3Q8TE85 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRHL3Q8TE85 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRHL3Q8TE85 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRHL3Q8TE85 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRHL3Q8TE85 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRHL3Q8TE85 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRHL3Q8TE85 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRHL3Q8TE85 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRHL3Q8TE85 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRHL3Q8TE85 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRHL3Q8TE85 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRHL3Q8TE85 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRHL3Q8TE85 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRHL3Q8TE85 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRHL3Q8TE85 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRHL3Q8TE85 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRHL3Q8TE85 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRHL3Q8TE85 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRHL3Q8TE85 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GRHL3Q8TE85 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.9 ms