Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE85

GRHL3, Grainyhead-like protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL3Q8TE85 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
GRHL3Q8TE85 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRHL3Q8TE85 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GRHL3Q8TE85 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GRHL3Q8TE85 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
GRHL3Q8TE85 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
GRHL3Q8TE85 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
GRHL3Q8TE85 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GRHL3Q8TE85 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GRHL3Q8TE85 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GRHL3Q8TE85 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GRHL3Q8TE85 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GRHL3Q8TE85 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
GRHL3Q8TE85 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GRHL3Q8TE85 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRHL3Q8TE85 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRHL3Q8TE85 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GRHL3Q8TE85 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRHL3Q8TE85 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRHL3Q8TE85 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRHL3Q8TE85 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRHL3Q8TE85 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRHL3Q8TE85 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRHL3Q8TE85 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRHL3Q8TE85 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRHL3Q8TE85 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GRHL3Q8TE85 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRHL3Q8TE85 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRHL3Q8TE85 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GRHL3Q8TE85 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GRHL3Q8TE85 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRHL3Q8TE85 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GRHL3Q8TE85 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GRHL3Q8TE85 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GRHL3Q8TE85 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GRHL3Q8TE85 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GRHL3Q8TE85 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GRHL3Q8TE85 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GRHL3Q8TE85 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GRHL3Q8TE85 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRHL3Q8TE85 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GRHL3Q8TE85 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GRHL3Q8TE85 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRHL3Q8TE85 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GRHL3Q8TE85 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
GRHL3Q8TE85 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GRHL3Q8TE85 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GRHL3Q8TE85 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GRHL3Q8TE85 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
GRHL3Q8TE85 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRHL3Q8TE85 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GRHL3Q8TE85 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GRHL3Q8TE85 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRHL3Q8TE85 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GRHL3Q8TE85 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRHL3Q8TE85 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRHL3Q8TE85 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GRHL3Q8TE85 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GRHL3Q8TE85 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRHL3Q8TE85 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GRHL3Q8TE85 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GRHL3Q8TE85 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GRHL3Q8TE85 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GRHL3Q8TE85 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GRHL3Q8TE85 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GRHL3Q8TE85 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GRHL3Q8TE85 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
GRHL3Q8TE85 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GRHL3Q8TE85 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
GRHL3Q8TE85 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GRHL3Q8TE85 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GRHL3Q8TE85 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GRHL3Q8TE85 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GRHL3Q8TE85 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GRHL3Q8TE85 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GRHL3Q8TE85 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GRHL3Q8TE85 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRHL3Q8TE85 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRHL3Q8TE85 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GRHL3Q8TE85 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRHL3Q8TE85 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRHL3Q8TE85 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GRHL3Q8TE85 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GRHL3Q8TE85 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GRHL3Q8TE85 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GRHL3Q8TE85 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRHL3Q8TE85 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GRHL3Q8TE85 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GRHL3Q8TE85 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GRHL3Q8TE85 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRHL3Q8TE85 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRHL3Q8TE85 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRHL3Q8TE85 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRHL3Q8TE85 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRHL3Q8TE85 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRHL3Q8TE85 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRHL3Q8TE85 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRHL3Q8TE85 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRHL3Q8TE85 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRHL3Q8TE85 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms