Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCARA3Q6AZY7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SCARA3Q6AZY7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCARA3Q6AZY7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCARA3Q6AZY7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCARA3Q6AZY7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCARA3Q6AZY7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCARA3Q6AZY7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCARA3Q6AZY7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCARA3Q6AZY7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCARA3Q6AZY7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCARA3Q6AZY7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCARA3Q6AZY7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCARA3Q6AZY7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCARA3Q6AZY7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCARA3Q6AZY7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCARA3Q6AZY7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCARA3Q6AZY7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCARA3Q6AZY7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCARA3Q6AZY7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCARA3Q6AZY7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCARA3Q6AZY7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCARA3Q6AZY7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SCARA3Q6AZY7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCARA3Q6AZY7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCARA3Q6AZY7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCARA3Q6AZY7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCARA3Q6AZY7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCARA3Q6AZY7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCARA3Q6AZY7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCARA3Q6AZY7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCARA3Q6AZY7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCARA3Q6AZY7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCARA3Q6AZY7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCARA3Q6AZY7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCARA3Q6AZY7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCARA3Q6AZY7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SCARA3Q6AZY7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCARA3Q6AZY7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCARA3Q6AZY7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SCARA3Q6AZY7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCARA3Q6AZY7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SCARA3Q6AZY7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCARA3Q6AZY7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCARA3Q6AZY7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SCARA3Q6AZY7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCARA3Q6AZY7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SCARA3Q6AZY7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCARA3Q6AZY7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCARA3Q6AZY7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCARA3Q6AZY7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCARA3Q6AZY7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SCARA3Q6AZY7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCARA3Q6AZY7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCARA3Q6AZY7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCARA3Q6AZY7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCARA3Q6AZY7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SCARA3Q6AZY7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCARA3Q6AZY7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SCARA3Q6AZY7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SCARA3Q6AZY7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCARA3Q6AZY7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SCARA3Q6AZY7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCARA3Q6AZY7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCARA3Q6AZY7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SCARA3Q6AZY7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCARA3Q6AZY7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCARA3Q6AZY7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCARA3Q6AZY7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SCARA3Q6AZY7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SCARA3Q6AZY7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SCARA3Q6AZY7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCARA3Q6AZY7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SCARA3Q6AZY7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCARA3Q6AZY7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SCARA3Q6AZY7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SCARA3Q6AZY7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SCARA3Q6AZY7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SCARA3Q6AZY7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCARA3Q6AZY7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCARA3Q6AZY7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCARA3Q6AZY7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SCARA3Q6AZY7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCARA3Q6AZY7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCARA3Q6AZY7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SCARA3Q6AZY7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SCARA3Q6AZY7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SCARA3Q6AZY7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCARA3Q6AZY7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCARA3Q6AZY7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SCARA3Q6AZY7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SCARA3Q6AZY7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCARA3Q6AZY7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SCARA3Q6AZY7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCARA3Q6AZY7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCARA3Q6AZY7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCARA3Q6AZY7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SCARA3Q6AZY7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCARA3Q6AZY7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SCARA3Q6AZY7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms